RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 POTEB2H3BUK9 544 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 M0R2C6 588 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 KCNA6P17658 529 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RXRAP19793 462 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ATP2B1P20020 1258 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.57■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MRC1P22897 1456 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PRR29P0C7W0 189 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 TIMM10P62072 90 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.042e-13■□□□□ 9.6
PRPF39-201ENST00000355765 PTPAQ15257 358 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RESP18Q5W5W9 173 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 DEF6Q9H4E7 631 aa21.56■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RNF40O75150 1001 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PDIA6Q15084 440 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 CTAGE9A4FU28 777 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF18P17022 549 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RBL2Q08999 1139 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ALG1Q9BT22 464 aa21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MED15Q96RN5 788 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 CTAGE8P0CG41 777 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 JMYQ8N9B5 988 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MYO1BO43795 1136 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.53■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 COPS6Q7L5N1 327 aa21.53■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PHKBQ93100 1093 aa21.53■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.53■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 KRT40Q6A162 431 aa21.53■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.53■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PPP6R2O75170 966 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PPFIA4O75335 1185 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 ANTXR2P58335 489 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 SLC39A6Q13433 755 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 OSBP2Q969R2 916 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 GRIN1Q05586 938 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 NR1I3Q14994 352 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 MAP3K14Q99558 947 aa21.52■■□□□ 1.04
PRPF39-201ENST00000355765 STX17P56962 302 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 POSTNQ15063 836 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 PANX2Q96RD6 677 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 GBP3Q9H0R5 595 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 WASHC4Q2M389 1173 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 PXDNQ92626 1479 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 LIG3P49916 1009 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 MED4Q9NPJ6 270 aa21.5■■□□□ 1.03
PRPF39-201ENST00000355765 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms