RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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SPNS3-201ENST00000355530 SENP2Q9HC62 589 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 CCP110O43303 1012 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PDE8AO60658 829 aa21.03■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
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SPNS3-201ENST00000355530 WASF1Q92558 559 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.02■□□□□ 0.96
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SPNS3-201ENST00000355530 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PNOCQ13519 176 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.02■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 ATP1A3P13637 1013 aa21.01■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 ISM2Q6H9L7 571 aa21.01■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.01■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 FGFR2P21802 821 aa21■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 UBASH3AP57075 661 aa21■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K12Q12852 859 aa21■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 KRT23Q9C075 422 aa21■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 CNNM3Q8NE01 707 aa20.99■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 MYL10Q9BUA6 226 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 BCORQ6W2J9 1755 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 MBD4O95243 580 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 ELF2Q15723 593 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.99■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 SLC5A1P13866 664 aa20.98■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 AK7Q96M32 723 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 MMP1P03956 469 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 VSTM4Q8IW00 320 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 RASGRF1Q13972 1273 aa20.96■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 DPF2Q92785 391 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 TMX1Q9H3N1 280 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS3-201ENST00000355530 GNAT2P19087 354 aa20.96■□□□□ 0.95
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SPNS3-201ENST00000355530 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
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SPNS3-201ENST00000355530 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 MTA3Q9BTC8 594 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 ARMT1Q9H993 441 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 INCENPQ9NQS7 918 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 SLAIN2Q9P270 581 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 RCAN1P53805 252 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 RTN1Q16799 776 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS3-201ENST00000355530 HOMER1Q86YM7 354 aa20.95■□□□□ 0.94
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