RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CXCL9Q07325 125 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TNIP1Q15025 636 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 HAUS7Q99871 368 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 RAD17O75943 681 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TPM3P06753 285 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZAP70P43403 619 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DACT2Q5SW24 774 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SNRKQ9NRH2 765 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 AKAP11Q9UKA4 1901 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SCN9AQ15858 1988 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PSMD14O00487 310 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CBX1P83916 185 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PI16Q6UXB8 463 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 CXorf38Q8TB03 319 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 FBXW7Q969H0 707 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 SKAP1Q86WV1 359 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GPC2Q8N158 579 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 OGFRQ9NZT2 677 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 JAG2Q9Y219 1238 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 SETSIPP0DME0 302 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 RPS12P25398 132 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 TTC22Q5TAA0 569 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 CERS5Q8N5B7 392 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 PSME4Q14997 1843 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 EVI5LQ96CN4 794 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GMLQ99445 158 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 ABCF2Q9UG63 623 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 SUFUQ9UMX1 484 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GLTPD2A6NH11 291 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 DPF2Q92785 391 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 MXD3Q9BW11 206 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 PRDX5P30044 214 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 ZNF280DQ6N043 979 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 CNTROBQ8N137 903 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 MRIQ9BWK5 157 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-201ENST00000351328 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms