RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CTAGE9A4FU28 777 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 TACC1O75410 805 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CTR9Q6PD62 1173 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 MTMR6Q9Y217 621 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 RASEFQ8IZ41 740 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 RGS12O14924 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 KIF5AQ12840 1032 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 KRT86O43790 486 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PDE6AP16499 860 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ARID5AQ03989 594 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 SV2BQ7L1I2 683 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ERBB3P21860 1342 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 FAM13AO94988 1023 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 MAP4K1Q92918 833 aa23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PPARAQ07869 468 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ZNF75DP51815 510 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PFKFB2O60825 505 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CNGA4Q8IV77 575 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 NEK11Q8NG66 645 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.4■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CERS3Q8IU89 383 aa23.39■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.39■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.39■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 USP37Q86T82 979 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CEP112Q8N8E3 955 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 NEBLO76041 1014 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 FGAP02671 866 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 FANCCQ00597 558 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 GREM2Q9H772 168 aa23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 NLRP12P59046 1061 aa23.38■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.38■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 JDP2Q8WYK2 163 aa23.38■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.38■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 BCAMP50895 628 aa23.38■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CTNNA2P26232 953 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 PTCH1Q13635 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 GYG1P46976 350 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 TFAP4Q01664 338 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 KRT222Q8N1A0 295 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MLKLQ8NB16 471 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 PDE4DQ08499 809 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 USP17L12C9JPN9 530 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 USP17L21D6R901 530 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ADORA1P30542 326 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 GPR108Q9NPR9 543 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA1Q92805 767 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 USP28Q96RU2 1077 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 VPS16Q9H269 839 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 MAST3O60307 1309 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ADCY9O60503 1353 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 CIAO1O76071 339 aa23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 TXKP42681 527 aa23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 USP21Q9UK80 565 aa23.35■■□□□ 1.33
NISCH-201ENST00000345716 PDE8BO95263 885 aa23.35■■□□□ 1.33
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