RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 LIFRP42702 1097 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 LY9Q9HBG7 655 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-201ENST00000331803 G3V3G9 751 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ESR2Q92731 530 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SBK1Q52WX2 424 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CERS3Q8IU89 383 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SLF2Q8IX21 1173 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 MTA3Q9BTC8 594 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SENP2Q9HC62 589 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 FGRP09769 529 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 USP5P45974 858 aa22.5■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 BTDP43251 543 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 APOA5Q6Q788 366 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 FBXW7Q969H0 707 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 KIF3AQ9Y496 699 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.49■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ERICH2A1L162 156 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 PODNQ7Z5L7 613 aa22.48■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CCDC69A6NI79 296 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CPLX1O14810 134 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB43O43298 467 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 USP17L8P0C7I0 530 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CYP2D6P10635 497 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 EVX2Q03828 476 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 WTAPQ15007 396 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 TMTC2Q8N394 836 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 CERS5Q8N5B7 392 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 GAKO14976 1311 aa22.47■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 H3BQV1 296 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 PPFIA3O75145 1194 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 PRDM1O75626 825 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 PLCG2P16885 1265 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 IFFO2Q5TF58 517 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
UPP1-201ENST00000331803 ORC4O43929 436 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 FERMT3Q86UX7 667 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 MICU3Q86XE3 530 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 RXRAP19793 462 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 C12orf60Q5U649 245 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.45■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 PDE4BQ07343 736 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 TTLL6Q8N841 843 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 MXD3Q9BW11 206 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 LAMB1P07942 1786 aa22.44■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 TNKSO95271 1327 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 F8W031 263 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 C21orf2O43822 256 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 RHBDL3P58872 404 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 USP48Q86UV5 1035 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 TEX11Q8IYF3 940 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 MYL10Q9BUA6 226 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.43■■□□□ 1.18
UPP1-201ENST00000331803 CDC27P30260 824 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms