RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1B-201ENST00000296642 SZT2Q5T011 3432 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEMA6NI47 508 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-201ENST00000296642 GRM8O00222 908 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1B-201ENST00000296642 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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PGGT1B-201ENST00000296642 ELNP15502 786 aa9.9□□□□□ -0.82
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PGGT1B-201ENST00000296642 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.89□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLF2Q8IX21 1173 aa9.88□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH1L1O75891 902 aa9.87□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.87□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A1P13866 664 aa9.86□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEGQ6S5H5 508 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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PGGT1B-201ENST00000296642 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM75PA6NK02 468 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIK5Q16478 980 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEB2H3BUK9 544 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 LPIN2Q92539 896 aa9.83□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 F6X3S4 739 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA3EO15041 775 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 MSCO60682 206 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 NFIAQ12857 509 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 WWC1Q8IX03 1113 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 IDI2Q9BXS1 227 aa9.82□□□□□ -0.84
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