RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 PICALMQ13492 652 aa28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 FAM151AQ8WW52 585 aa28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
RAB20-201ENST00000267328 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 FOXP2O15409 715 aa28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 RASA3Q14644 834 aa28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 VPS53Q5VIR6 699 aa28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 SULF1Q8IWU6 871 aa28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.32■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 TCP10Q12799 353 aa28.31■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.31■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.3■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.3■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.3■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.3■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 CHADLQ6NUI6 762 aa28.29■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 ADM5C9JUS6 153 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 TEPSINQ96N21 525 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.28■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 APPP05067 770 aa28.27■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 ALX1Q15699 326 aa28.27■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.27■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 USP48Q86UV5 1035 aa28.27■■■□□ 2.12
RAB20-201ENST00000267328 ZMYM6O95789 1325 aa28.26■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 TOMM70O94826 608 aa28.26■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 C8orf34Q49A92 452 aa28.26■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.26■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 LAMB1P07942 1786 aa28.26■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 SIPA1L1O43166 1804 aa28.25■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 TDO2P48775 406 aa28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 NAPBQ9H115 298 aa28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 FGAP02671 866 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 PTH1RQ03431 593 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 SBK1Q52WX2 424 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 PALD1Q9ULE6 856 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 CTR9Q6PD62 1173 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.23■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 USP17L12C9JPN9 530 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 USP17L21D6R901 530 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 MAP4K1Q92918 833 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 CDCA5Q96FF9 252 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 CSRNP1Q96S65 589 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 LAMA4Q16363 1823 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 C12orf60Q5U649 245 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 DLK2Q6UY11 383 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 TTC6Q86TZ1 520 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.2■■■□□ 2.11
RAB20-201ENST00000267328 REC8O95072 547 aa28.2■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 HLA-DOAP06340 250 aa28.2■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.2■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.2■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 PLCD1P51178 756 aa28.19■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.19■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.19■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 TRAF5O00463 557 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 CYP2D6P10635 497 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 HOOK2Q96ED9 719 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 EHD4Q9H223 541 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.18■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 MAP3K10Q02779 954 aa28.17■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 EVX2Q03828 476 aa28.17■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 FSTL1Q12841 308 aa28.17■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.17■■■□□ 2.1
RAB20-201ENST00000267328 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms