RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 CACNA1SQ13698 1873 aa18.79■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 PRDX5P30044 214 aa18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 CBX8Q9HC52 389 aa18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 ZMYM6O95789 1325 aa18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 ADRA2BP18089 450 aa18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 APOA5Q6Q788 366 aa18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 SERPINB2P05120 415 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 MECOMQ03112 1051 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 GRAPQ13588 217 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 PROM2Q8N271 834 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 LY9Q9HBG7 655 aa18.77■□□□□ 0.6
GINS2-201ENST00000253462 CDC27P30260 824 aa18.77■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 PPARAQ07869 468 aa18.77■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 TMEM87BQ96K49 555 aa18.77■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 A0A087WWV3 80 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 PHKBQ93100 1093 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 C8orf76Q96K31 380 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 KRT23Q9C075 422 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.76■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 PTGS1P23219 599 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 TXNRD1Q16881 649 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 AIFM3Q96NN9 605 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 SEMA3EO15041 775 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 ZBTB43O43298 467 aa18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CFAP45Q9UL16 551 aa18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CCDC69A6NI79 296 aa18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 ST5P78524 1137 aa18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 EVX2Q03828 476 aa18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 USP28Q96RU2 1077 aa18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 SLC12A7Q9Y666 1083 aa18.74■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.73■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.73■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 PRDM1O75626 825 aa18.73■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 DDR1Q08345 913 aa18.73■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.73■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.73■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 LRMPQ12912 555 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 DYNC1I1O14576 645 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 GPSM2P81274 684 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.72■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 XDHP47989 1333 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 LIFRP42702 1097 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 ZNF165P49910 485 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 WTAPQ15007 396 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 TRIM5Q9C035 493 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 USP17L12C9JPN9 530 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 USP17L21D6R901 530 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 DRC7Q8IY82 874 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.71■□□□□ 0.59
GINS2-201ENST00000253462 ERICH2A1L162 156 aa18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 ALG1Q9BT22 464 aa18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 CTR9Q6PD62 1173 aa18.7■□□□□ 0.58
GINS2-201ENST00000253462 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms