RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052747.3

Nhlrc1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Nhlrc1, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Lmod3E9QA62 571 aa26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tnni2P13412 182 aa26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gnat2P50149 354 aa26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfm5Q8BU90 496 aa26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Frat2Q8K025 231 aa26.86■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cdc27A2A6Q5 825 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Efcc1Q9JJF6 558 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm10134F6ZQC6 126 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Samsn1P57725 372 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ifit1bl2Q3U687 466 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ctdspl2Q8BG15 465 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Miga2Q8BK03 593 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa26.85■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Etnk1Q9D4V0 363 aa26.84■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Kndc1Q0KK55 1742 aa26.84■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Dennd3A2RT67 1274 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 GabrdP22933 449 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cyp7b1Q60991 507 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Terb1Q8C0V1 768 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tubgcp2Q921G8 905 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 GmnnO88513 206 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pde11aP0C1Q2 933 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Myo1bP46735 1107 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tnnt2P50752 301 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Q3TYL0 343 aa26.83■■□□□ 1.89
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gm5624F6ZZG8 207 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Znf496Q5SXI5 585 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ttc12Q8BW49 704 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tspyl4Q8VD63 406 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ginm1Q91WR6 327 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Stk39Q9Z1W9 556 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc7a1Q09143 622 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 PsdQ5DTT2 1024 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ift122Q6NWV3 1182 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vps33aQ9D2N9 598 aa26.82■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cyp24a1Q64441 514 aa26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Mtmr6Q8VE11 617 aa26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ccdc121E9Q6D3 323 aa26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Q8K2W9 541 aa26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Popdc2Q9ES82 367 aa26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Clec16aQ80U30 1036 aa26.8■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Rnf41Q8BH75 317 aa26.8■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa26.8■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Otop3Q80UF9 577 aa26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc39a11Q8BWY7 342 aa26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tfcp2Q9ERA0 502 aa26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 1700029H14RikE9PY36 240 aa26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ttc14Q9CSP9 761 aa26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 SsbP32067 415 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Siah1aP61092 282 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr119Q7TRJ5 321 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Klhl30Q8C3F7 581 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Cep89Q9CZX2 791 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc27a1Q60714 646 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Krt39Q6IFX4 482 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Krt23Q99PS0 422 aa26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Diaph1O08808 1255 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Pex1Q5BL07 1284 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Zscan20B2KFW1 1030 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Usp49Q6P9L4 685 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ankrd23Q812A3 306 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Vps16Q920Q4 839 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa26.77■■□□□ 1.88
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Myh3P13541 1940 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Casp1P29452 402 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Fam89aQ14BJ1 175 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Acad12D3Z7X0 555 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Abl1P00520 1123 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Sept9Q80UG5 583 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Trip6Q9Z1Y4 480 aa26.76■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Myo3bQ1EG27 1305 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Samd1D3YXK1 519 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Slc7a3P70423 618 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Sec23aQ01405 765 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Asnsd1Q8BFS9 627 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Tgs1Q923W1 853 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Iqca1Q9CUL5 857 aa26.75■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 PnnO35691 725 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Prl7d1P04769 244 aa26.74■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Olfr118Q7TRJ6 321 aa26.74■■□□□ 1.87
Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 Abcb6Q9DC29 842 aa26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms