RNA–Protein interactions for RNA: YOR266W

PNT1, Transcript of Mitochondrial integral inner membrane protein, yeast

Gene PNT1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PNT1	YOR266W	DAN4	P47179	1161 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PNT1	YOR266W	YDL129W	Q07555	291 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PNT1	YOR266W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	8.43	□□□□□ -1.06
PNT1	YOR266W	DCW1	P36091	449 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PNT1	YOR266W	YEL023C	P39992	682 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PNT1	YOR266W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	8.39	□□□□□ -1.07
PNT1	YOR266W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	8.38	□□□□□ -1.07
PNT1	YOR266W	SAP30	P38429	201 aa		8.37	□□□□□ -1.07
PNT1	YOR266W	GUT1	P32190	709 aa		8.35	□□□□□ -1.07
PNT1	YOR266W	MIF2	P35201	549 aa		8.35	□□□□□ -1.07
PNT1	YOR266W	ATH1	P48016	1211 aa		8.35	□□□□□ -1.07
PNT1	YOR266W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
PNT1	YOR266W	RAM2	P29703	316 aa		8.32	□□□□□ -1.08
PNT1	YOR266W	PRE3	P38624	215 aa		8.32	□□□□□ -1.08
PNT1	YOR266W	BCK2	P33306	851 aa		8.31	□□□□□ -1.08
PNT1	YOR266W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	8.3	□□□□□ -1.08
PNT1	YOR266W	COQ8	P27697	501 aa		8.26	□□□□□ -1.09
PNT1	YOR266W	EDS1	P38073	919 aa		8.23	□□□□□ -1.09
PNT1	YOR266W	LEU3	P08638	886 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PNT1	YOR266W	PML39	Q03760	334 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PNT1	YOR266W	AI4	P03878	556 aa		8.2	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	LEO1	P38439	464 aa		8.18	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	8.18	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	8.18	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	MPH3	P0CE00	602 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	ARH1	P48360	493 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	YPR148C	Q06523	435 aa		8.16	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	PEX29	Q03370	554 aa		8.15	□□□□□ -1.1
PNT1	YOR266W	XDJ1	P39102	459 aa		8.13	□□□□□ -1.11
PNT1	YOR266W	IFH1	P39520	1085 aa		8.13	□□□□□ -1.11
PNT1	YOR266W	NST1	P53935	1240 aa		8.13	□□□□□ -1.11
PNT1	YOR266W	SPT23	P35210	1082 aa		8.09	□□□□□ -1.11
PNT1	YOR266W	VRP1	P37370	817 aa		8.09	□□□□□ -1.11
PNT1	YOR266W	YGR273C	P53329	174 aa		8.08	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	SOL3	P38858	249 aa		8.07	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	CKB1	P43639	278 aa		8.06	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	HAP5	Q02516	242 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	MID1	P41821	548 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	VPS70	P47161	811 aa		8.04	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	BNI4	P53858	892 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	TAF7	Q05021	590 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PNT1	YOR266W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PNT1	YOR266W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	7.97	□□□□□ -1.13
PNT1	YOR266W	MPC54	Q08550	464 aa		7.97	□□□□□ -1.13
PNT1	YOR266W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	YDR344C	Q05510	147 aa		7.96	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	DPL1	Q05567	589 aa		7.95	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	DSF2	P38213	736 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	SLI15	P38283	698 aa		7.92	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	NMA111	P53920	997 aa		7.91	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	KEX1	P09620	729 aa		7.9	□□□□□ -1.14
PNT1	YOR266W	PBS2	P08018	668 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PNT1	YOR266W	ISU2	Q12056	156 aa		7.88	□□□□□ -1.15
PNT1	YOR266W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
PNT1	YOR266W	RAD54	P32863	898 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	MAM3	Q12296	706 aa		7.8	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	KIC1	P38692	1080 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	SAS4	Q04003	481 aa		7.78	□□□□□ -1.16
PNT1	YOR266W	VHR2	P40041	505 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PNT1	YOR266W	IES2	P40154	320 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PNT1	YOR266W	CDC73	Q06697	393 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PNT1	YOR266W	COX6	P00427	148 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PNT1	YOR266W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.73	□□□□□ -1.17	not detected
PNT1	YOR266W	GYP1	Q08484	637 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PNT1	YOR266W	RAM1	P22007	431 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	AIM7	Q12156	149 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	PEX21	P50091	288 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	YDR090C	Q03193	310 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	GLC3	P32775	704 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	CSC1	Q06538	782 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	TFB4	Q12004	338 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	YPR015C	Q12531	247 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	KIN1	P13185	1064 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	AMS1	P22855	1083 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	DIT2	P21595	489 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PNT1	YOR266W	DMA2	P53924	522 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PNT1	YOR266W	SRC1	Q03707	834 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PNT1	YOR266W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
PNT1	YOR266W	PDR1	P12383	1068 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PNT1	YOR266W	TRK1	P12685	1235 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	NPL4	P33755	580 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	YRR1	Q12172	810 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	RAS1	P01119	309 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	ATF2	P53296	535 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	ORC6	P38826	435 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
PNT1	YOR266W	ERG12	P07277	443 aa		7.53	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms