RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600667.2

PDE4C-216, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4C, Length 702 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-216ENST00000600667 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.18■■□□□ 1.94
PDE4C-216ENST00000600667 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.15■■□□□ 1.94
PDE4C-216ENST00000600667 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.12■■□□□ 1.93
PDE4C-216ENST00000600667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.1■■□□□ 1.93
PDE4C-216ENST00000600667 IGF1RP08069 1367 aa27.06■■□□□ 1.92
PDE4C-216ENST00000600667 MAPKBP1O60336 1514 aa27.05■■□□□ 1.92
PDE4C-216ENST00000600667 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.03■■□□□ 1.92
PDE4C-216ENST00000600667 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.98■■□□□ 1.91
PDE4C-216ENST00000600667 KIF27Q86VH2 1401 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4C-216ENST00000600667 DIP2BQ9P265 1576 aa26.97■■□□□ 1.91
PDE4C-216ENST00000600667 PTPRGP23470 1445 aa26.89■■□□□ 1.89
PDE4C-216ENST00000600667 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.86■■□□□ 1.89
PDE4C-216ENST00000600667 CUL7Q14999 1698 aa26.85■■□□□ 1.89
PDE4C-216ENST00000600667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.84■■□□□ 1.89
PDE4C-216ENST00000600667 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PDE4C-216ENST00000600667 KDM6BO15054 1643 aa26.82■■□□□ 1.88
PDE4C-216ENST00000600667 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.8■■□□□ 1.88
PDE4C-216ENST00000600667 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.79■■□□□ 1.88
PDE4C-216ENST00000600667 ABCC2Q92887 1545 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4C-216ENST00000600667 TSPOAP1O95153 1857 aa26.74■■□□□ 1.87
PDE4C-216ENST00000600667 ASXL2Q76L83 1435 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4C-216ENST00000600667 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.7■■□□□ 1.87
PDE4C-216ENST00000600667 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.66■■□□□ 1.86
PDE4C-216ENST00000600667 UACAQ9BZF9 1416 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4C-216ENST00000600667 IQGAP2Q13576 1575 aa26.64■■□□□ 1.86
PDE4C-216ENST00000600667 GLI2P10070 1586 aa26.63■■□□□ 1.85
PDE4C-216ENST00000600667 DISP1Q96F81 1524 aa26.6■■□□□ 1.85
PDE4C-216ENST00000600667 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4C-216ENST00000600667 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PDE4C-216ENST00000600667 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PDE4C-216ENST00000600667 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PDE4C-216ENST00000600667 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4C-216ENST00000600667 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.5■■□□□ 1.83
PDE4C-216ENST00000600667 ADGRL1O94910 1474 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4C-216ENST00000600667 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.44■■□□□ 1.82
PDE4C-216ENST00000600667 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.42■■□□□ 1.82
PDE4C-216ENST00000600667 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PDE4C-216ENST00000600667 KIAA0556O60303 1618 aa26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-216ENST00000600667 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PDE4C-216ENST00000600667 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.36■■□□□ 1.81
PDE4C-216ENST00000600667 KCNH8Q96L42 1107 aa26.31■■□□□ 1.8
PDE4C-216ENST00000600667 CD109Q6YHK3 1445 aa26.29■■□□□ 1.8
PDE4C-216ENST00000600667 GOLGA3Q08378 1498 aa26.27■■□□□ 1.8
PDE4C-216ENST00000600667 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.25■■□□□ 1.79
PDE4C-216ENST00000600667 ABCA8O94911 1581 aa26.21■■□□□ 1.79
PDE4C-216ENST00000600667 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.18■■□□□ 1.78
PDE4C-216ENST00000600667 PRXQ9BXM0 1461 aa26.16■■□□□ 1.78
PDE4C-216ENST00000600667 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4C-216ENST00000600667 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.15■■□□□ 1.78
PDE4C-216ENST00000600667 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PDE4C-216ENST00000600667 ARID3CA6NKF2 412 aa26.09■■□□□ 1.77
PDE4C-216ENST00000600667 P3H3Q8IVL6 736 aa26.08■■□□□ 1.77
PDE4C-216ENST00000600667 ATP10BO94823 1461 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4C-216ENST00000600667 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.06■■□□□ 1.76
PDE4C-216ENST00000600667 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.02■■□□□ 1.76
PDE4C-216ENST00000600667 KIF21BO75037 1637 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4C-216ENST00000600667 RAPGEF3O95398 923 aa25.96■■□□□ 1.75
PDE4C-216ENST00000600667 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.94■■□□□ 1.74
PDE4C-216ENST00000600667 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PDE4C-216ENST00000600667 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PDE4C-216ENST00000600667 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.91■■□□□ 1.74
PDE4C-216ENST00000600667 NEO1Q92859 1461 aa25.89■■□□□ 1.73
PDE4C-216ENST00000600667 PTPRMP28827 1452 aa25.87■■□□□ 1.73
PDE4C-216ENST00000600667 SAMD9Q5K651 1589 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4C-216ENST00000600667 FBXO41Q8TF61 875 aa25.83■■□□□ 1.73
PDE4C-216ENST00000600667 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PDE4C-216ENST00000600667 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4C-216ENST00000600667 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.82■■□□□ 1.72
PDE4C-216ENST00000600667 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PDE4C-216ENST00000600667 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4C-216ENST00000600667 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PDE4C-216ENST00000600667 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4C-216ENST00000600667 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.73■■□□□ 1.71
PDE4C-216ENST00000600667 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PDE4C-216ENST00000600667 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4C-216ENST00000600667 AKNAQ7Z591 1439 aa25.7■■□□□ 1.7
PDE4C-216ENST00000600667 MADDQ8WXG6 1647 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4C-216ENST00000600667 EEA1Q15075 1411 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4C-216ENST00000600667 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PDE4C-216ENST00000600667 FANCAO15360 1455 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4C-216ENST00000600667 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4C-216ENST00000600667 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4C-216ENST00000600667 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
PDE4C-216ENST00000600667 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4C-216ENST00000600667 RICTORQ6R327 1708 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4C-216ENST00000600667 HSPA2P54652 639 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.55■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.54■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 MLECQ14165 292 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.52■■□□□ 1.68
PDE4C-216ENST00000600667 PLCH2O75038 1416 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4C-216ENST00000600667 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.51■■□□□ 1.67
PDE4C-216ENST00000600667 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PDE4C-216ENST00000600667 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.46■■□□□ 1.67
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