RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.54■■■■□ 3.12
USP36-218ENST00000590546 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.5■■■■□ 3.11
USP36-218ENST00000590546 ADAMTS12P58397 1594 aa34.45■■■■□ 3.11
USP36-218ENST00000590546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
USP36-218ENST00000590546 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
USP36-218ENST00000590546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
USP36-218ENST00000590546 MAP3K1Q13233 1512 aa34.31■■■■□ 3.08
USP36-218ENST00000590546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
USP36-218ENST00000590546 SAMD9Q5K651 1589 aa34.24■■■■□ 3.07
USP36-218ENST00000590546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.24■■■■□ 3.07
USP36-218ENST00000590546 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.21■■■■□ 3.07
USP36-218ENST00000590546 FMN1Q68DA7 1419 aa34.21■■■■□ 3.07
USP36-218ENST00000590546 P3H3Q8IVL6 736 aa34.18■■■■□ 3.06
USP36-218ENST00000590546 IQGAP2Q13576 1575 aa34.17■■■■□ 3.06
USP36-218ENST00000590546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.16■■■■□ 3.06
USP36-218ENST00000590546 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
USP36-218ENST00000590546 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.15■■■■□ 3.06
USP36-218ENST00000590546 TIAM1Q13009 1591 aa34.15■■■■□ 3.06
USP36-218ENST00000590546 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
USP36-218ENST00000590546 GRIN2AQ12879 1464 aa34.13■■■■□ 3.05
USP36-218ENST00000590546 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
USP36-218ENST00000590546 SYNJ2O15056 1496 aa34.11■■■■□ 3.05
USP36-218ENST00000590546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.09■■■■□ 3.05
USP36-218ENST00000590546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.04■■■■□ 3.04
USP36-218ENST00000590546 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.04■■■■□ 3.04
USP36-218ENST00000590546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
USP36-218ENST00000590546 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.01■■■■□ 3.03
USP36-218ENST00000590546 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.02
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USP36-218ENST00000590546 NUP160Q12769 1436 aa33.88■■■■□ 3.01
USP36-218ENST00000590546 CEP170Q5SW79 1584 aa33.85■■■■□ 3.01
USP36-218ENST00000590546 FBLN2P98095 1184 aa33.82■■■■□ 3
USP36-218ENST00000590546 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.81■■■■□ 3
USP36-218ENST00000590546 KIAA0556O60303 1618 aa33.8■■■■□ 3
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USP36-218ENST00000590546 DISP1Q96F81 1524 aa33.79■■■■□ 3
USP36-218ENST00000590546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.78■■■■□ 3
USP36-218ENST00000590546 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
USP36-218ENST00000590546 HECW1Q76N89 1606 aa33.77■■■■□ 3
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USP36-218ENST00000590546 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.68■■■□□ 2.98
USP36-218ENST00000590546 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.68■■■□□ 2.98
USP36-218ENST00000590546 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.66■■■□□ 2.98
USP36-218ENST00000590546 JPH4Q96JJ6 628 aa33.66■■■□□ 2.98
USP36-218ENST00000590546 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.64■■■□□ 2.98
USP36-218ENST00000590546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
USP36-218ENST00000590546 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.58■■■□□ 2.97
USP36-218ENST00000590546 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
USP36-218ENST00000590546 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.53■■■□□ 2.96
USP36-218ENST00000590546 CHD1O14646 1710 aa33.52■■■□□ 2.96
USP36-218ENST00000590546 NCOA2Q15596 1464 aa33.49■■■□□ 2.95
USP36-218ENST00000590546 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.45■■■□□ 2.95
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF11O15085 1522 aa33.44■■■□□ 2.94
USP36-218ENST00000590546 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
USP36-218ENST00000590546 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
USP36-218ENST00000590546 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.43■■■□□ 2.94
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USP36-218ENST00000590546 SHROOM2Q13796 1616 aa33.34■■■□□ 2.93
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USP36-218ENST00000590546 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.33■■■□□ 2.93
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USP36-218ENST00000590546 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.25■■■□□ 2.91
USP36-218ENST00000590546 ARID3CA6NKF2 412 aa33.23■■■□□ 2.91
USP36-218ENST00000590546 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.22■■■□□ 2.91
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USP36-218ENST00000590546 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
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USP36-218ENST00000590546 ATP10BO94823 1461 aa33.1■■■□□ 2.89
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USP36-218ENST00000590546 HFM1A2PYH4 1435 aa33.03■■■□□ 2.88
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USP36-218ENST00000590546 AKNAQ7Z591 1439 aa32.96■■■□□ 2.87
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USP36-218ENST00000590546 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.86■■■□□ 2.85
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USP36-218ENST00000590546 ROCK1Q13464 1354 aa32.82■■■□□ 2.85
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USP36-218ENST00000590546 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.81■■■□□ 2.84
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USP36-218ENST00000590546 ABCC5O15440 1437 aa32.79■■■□□ 2.84
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