RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576677.5

TBCD-222, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 1 (best)

Gene TBCD, Length 1,926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-222	ENST00000576677	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.77	■■■■□ 3
TBCD-222	ENST00000576677	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.75	■■■□□ 2.99
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
TBCD-222	ENST00000576677	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TBCD-222	ENST00000576677	ADAMTS12	P58397	1594 aa		33.71	■■■□□ 2.99
TBCD-222	ENST00000576677	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
TBCD-222	ENST00000576677	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TBCD-222	ENST00000576677	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
TBCD-222	ENST00000576677	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TBCD-222	ENST00000576677	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.57	■■■□□ 2.97
TBCD-222	ENST00000576677	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TBCD-222	ENST00000576677	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
TBCD-222	ENST00000576677	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
TBCD-222	ENST00000576677	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TBCD-222	ENST00000576677	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.51	■■■□□ 2.95
TBCD-222	ENST00000576677	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TBCD-222	ENST00000576677	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TBCD-222	ENST00000576677	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TBCD-222	ENST00000576677	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TBCD-222	ENST00000576677	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
TBCD-222	ENST00000576677	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TBCD-222	ENST00000576677	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TBCD-222	ENST00000576677	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
TBCD-222	ENST00000576677	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.37	■■■□□ 2.93
TBCD-222	ENST00000576677	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
TBCD-222	ENST00000576677	SYNJ2	O15056	1496 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TBCD-222	ENST00000576677	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TBCD-222	ENST00000576677	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
TBCD-222	ENST00000576677	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
TBCD-222	ENST00000576677	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TBCD-222	ENST00000576677	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
TBCD-222	ENST00000576677	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
TBCD-222	ENST00000576677	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TBCD-222	ENST00000576677	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TBCD-222	ENST00000576677	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TBCD-222	ENST00000576677	NUP160	Q12769	1436 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TBCD-222	ENST00000576677	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TBCD-222	ENST00000576677	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TBCD-222	ENST00000576677	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TBCD-222	ENST00000576677	FBLN2	P98095	1184 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TBCD-222	ENST00000576677	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TBCD-222	ENST00000576677	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TBCD-222	ENST00000576677	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TBCD-222	ENST00000576677	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.95	■■■□□ 2.87
TBCD-222	ENST00000576677	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TBCD-222	ENST00000576677	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.86	■■■□□ 2.85	4e-7	■■■□□ 18.2
TBCD-222	ENST00000576677	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	ITGAE	P38570	1179 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TBCD-222	ENST00000576677	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TBCD-222	ENST00000576677	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TBCD-222	ENST00000576677	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TBCD-222	ENST00000576677	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TBCD-222	ENST00000576677	CHD1	O14646	1710 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TBCD-222	ENST00000576677	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TBCD-222	ENST00000576677	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TBCD-222	ENST00000576677	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TBCD-222	ENST00000576677	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TBCD-222	ENST00000576677	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TBCD-222	ENST00000576677	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TBCD-222	ENST00000576677	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TBCD-222	ENST00000576677	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TBCD-222	ENST00000576677	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TBCD-222	ENST00000576677	ABCA8	O94911	1581 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TBCD-222	ENST00000576677	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TBCD-222	ENST00000576677	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TBCD-222	ENST00000576677	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TBCD-222	ENST00000576677	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
TBCD-222	ENST00000576677	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TBCD-222	ENST00000576677	PTPRG	P23470	1445 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TBCD-222	ENST00000576677	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TBCD-222	ENST00000576677	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TBCD-222	ENST00000576677	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TBCD-222	ENST00000576677	ATP10B	O94823	1461 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TBCD-222	ENST00000576677	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TBCD-222	ENST00000576677	KIF14	Q15058	1648 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TBCD-222	ENST00000576677	NAIP	Q13075	1403 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
TBCD-222	ENST00000576677	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TBCD-222	ENST00000576677	DAPK1	P53355	1430 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TBCD-222	ENST00000576677	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TBCD-222	ENST00000576677	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TBCD-222	ENST00000576677	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.2	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	ABCC5	O15440	1437 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TBCD-222	ENST00000576677	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.15	■■■□□ 2.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms