RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD3-209ENST00000561136 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD3-209ENST00000561136 POTEJP0CG39 1038 aa12.65□□□□□ -0.38
TMOD3-209ENST00000561136 SLC39A7Q92504 469 aa12.65□□□□□ -0.38
TMOD3-209ENST00000561136 C7P10643 843 aa12.63□□□□□ -0.39
TMOD3-209ENST00000561136 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD3-209ENST00000561136 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.57□□□□□ -0.4
TMOD3-209ENST00000561136 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.55□□□□□ -0.4
TMOD3-209ENST00000561136 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
TMOD3-209ENST00000561136 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
TMOD3-209ENST00000561136 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
TMOD3-209ENST00000561136 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.51□□□□□ -0.41
TMOD3-209ENST00000561136 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.5□□□□□ -0.41
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.5□□□□□ -0.41
TMOD3-209ENST00000561136 KIF12Q96FN5 646 aa12.46□□□□□ -0.41
TMOD3-209ENST00000561136 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TMOD3-209ENST00000561136 TRPC6Q9Y210 931 aa12.44□□□□□ -0.42
TMOD3-209ENST00000561136 POTEFA5A3E0 1075 aa12.43□□□□□ -0.42
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K13O43283 966 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD3-209ENST00000561136 PROM2Q8N271 834 aa12.36□□□□□ -0.43
TMOD3-209ENST00000561136 TIE1P35590 1138 aa12.34□□□□□ -0.43
TMOD3-209ENST00000561136 SEC24BO95487 1268 aa12.33□□□□□ -0.44
TMOD3-209ENST00000561136 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TMOD3-209ENST00000561136 RASEFQ8IZ41 740 aa12.32□□□□□ -0.44
TMOD3-209ENST00000561136 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHG5O94827 1062 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD3-209ENST00000561136 MIER1Q8N108 512 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD3-209ENST00000561136 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.23□□□□□ -0.45
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.2□□□□□ -0.46
TMOD3-209ENST00000561136 IER5LQ5T953 404 aa12.18□□□□□ -0.46
TMOD3-209ENST00000561136 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.17□□□□□ -0.46
TMOD3-209ENST00000561136 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.15□□□□□ -0.46
TMOD3-209ENST00000561136 ST18O60284 1047 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD3-209ENST00000561136 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.14□□□□□ -0.47
TMOD3-209ENST00000561136 IFNL1Q8IU54 200 aa12.11□□□□□ -0.47
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD3-209ENST00000561136 PLCG2P16885 1265 aa12.08□□□□□ -0.48
TMOD3-209ENST00000561136 NUBP1P53384 320 aa12.07□□□□□ -0.48
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC9O60706 1549 aa12.06□□□□□ -0.48
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TMOD3-209ENST00000561136 FAM212AQ96EL1 285 aa12.01□□□□□ -0.49
TMOD3-209ENST00000561136 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TMOD3-209ENST00000561136 MMRN1Q13201 1228 aa11.97□□□□□ -0.49
TMOD3-209ENST00000561136 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.95□□□□□ -0.5
TMOD3-209ENST00000561136 OCEL1Q9H607 264 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD3-209ENST00000561136 MARVELD3Q96A59 401 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD3-209ENST00000561136 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TMOD3-209ENST00000561136 SNPHO15079 494 aa11.9□□□□□ -0.5
TMOD3-209ENST00000561136 PYGBP11216 843 aa11.89□□□□□ -0.51
TMOD3-209ENST00000561136 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.88□□□□□ -0.51
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.87□□□□□ -0.51
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.78□□□□□ -0.52
TMOD3-209ENST00000561136 EMP3P54852 163 aa11.78□□□□□ -0.52
TMOD3-209ENST00000561136 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.77□□□□□ -0.53
TMOD3-209ENST00000561136 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TMOD3-209ENST00000561136 GOLGA2Q08379 1002 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD3-209ENST00000561136 FKBP8Q14318 412 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD3-209ENST00000561136 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TMOD3-209ENST00000561136 POTEB3A0JP26 581 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 FAM205CA6NFA0 338 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 POTEBQ6S5H4 581 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.69□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.69□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TMOD3-209ENST00000561136 GSE1Q14687 1217 aa11.61□□□□□ -0.55
TMOD3-209ENST00000561136 PSEN1P49768 467 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD3-209ENST00000561136 KLHL34Q8N239 644 aa11.6□□□□□ -0.55
TMOD3-209ENST00000561136 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.58□□□□□ -0.56
TMOD3-209ENST00000561136 FBXO3Q9UK99 471 aa11.57□□□□□ -0.56
TMOD3-209ENST00000561136 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TMOD3-209ENST00000561136 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 G3V3G9 751 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 CABP2Q9NPB3 220 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 ERBB3P21860 1342 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TMOD3-209ENST00000561136 DOK7Q18PE1 504 aa11.42□□□□□ -0.58
TMOD3-209ENST00000561136 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TMOD3-209ENST00000561136 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-209ENST00000561136 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TMOD3-209ENST00000561136 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-209ENST00000561136 RIMBP2O15034 1052 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-209ENST00000561136 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-209ENST00000561136 SPOCK2Q92563 424 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-209ENST00000561136 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-209ENST00000561136 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-209ENST00000561136 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD3-209ENST00000561136 MICALL2Q8IY33 904 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD3-209ENST00000561136 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms