RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559362.5

AKAP13-211, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, humanhuman

TSL 2

Gene AKAP13, Length 5,459 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP13-211ENST00000559362 ERCC6Q03468 1493 aa22.66■■□□□ 1.22
AKAP13-211ENST00000559362 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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AKAP13-211ENST00000559362 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
AKAP13-211ENST00000559362 MRS2Q9HD23 443 aa22.62■■□□□ 1.21
AKAP13-211ENST00000559362 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
AKAP13-211ENST00000559362 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
AKAP13-211ENST00000559362 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
AKAP13-211ENST00000559362 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
AKAP13-211ENST00000559362 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
AKAP13-211ENST00000559362 MIER1Q8N108 512 aa22.48■■□□□ 1.19
AKAP13-211ENST00000559362 RGL3Q3MIN7 710 aa22.47■■□□□ 1.19
AKAP13-211ENST00000559362 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
AKAP13-211ENST00000559362 CUX2O14529 1486 aa22.47■■□□□ 1.19
AKAP13-211ENST00000559362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.45■■□□□ 1.18
AKAP13-211ENST00000559362 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.45■■□□□ 1.18
AKAP13-211ENST00000559362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.44■■□□□ 1.18
AKAP13-211ENST00000559362 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AKAP13-211ENST00000559362 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.41■■□□□ 1.18
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AKAP13-211ENST00000559362 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AKAP13-211ENST00000559362 SOGA1O94964 1423 aa22.41■■□□□ 1.18
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AKAP13-211ENST00000559362 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.38■■□□□ 1.17
AKAP13-211ENST00000559362 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.38■■□□□ 1.17
AKAP13-211ENST00000559362 SMARCA2P51531 1590 aa22.38■■□□□ 1.17
AKAP13-211ENST00000559362 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
AKAP13-211ENST00000559362 CDCA8Q53HL2 280 aa22.35■■□□□ 1.17
AKAP13-211ENST00000559362 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.33■■□□□ 1.17
AKAP13-211ENST00000559362 C14orf37Q86TY3 774 aa22.3■■□□□ 1.16
AKAP13-211ENST00000559362 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.28■■□□□ 1.16
AKAP13-211ENST00000559362 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.27■■□□□ 1.16
AKAP13-211ENST00000559362 ABCC8Q09428 1581 aa22.26■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 CFAP53Q96M91 514 aa22.26■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.25■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.25■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.25■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 PLEKHG5O94827 1062 aa22.21■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
AKAP13-211ENST00000559362 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.19■■□□□ 1.14
AKAP13-211ENST00000559362 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
AKAP13-211ENST00000559362 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.16■■□□□ 1.14
AKAP13-211ENST00000559362 A0A0G2JS52 829 aa22.16■■□□□ 1.14
AKAP13-211ENST00000559362 KANK1Q14678 1352 aa22.15■■□□□ 1.14
AKAP13-211ENST00000559362 POGKQ9P215 609 aa22.14■■□□□ 1.13
AKAP13-211ENST00000559362 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.13■■□□□ 1.13
AKAP13-211ENST00000559362 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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AKAP13-211ENST00000559362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
AKAP13-211ENST00000559362 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.08■■□□□ 1.13
AKAP13-211ENST00000559362 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.07■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 FMN1Q68DA7 1419 aa22.05■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 NUDCQ9Y266 331 aa22.04■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.04■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
AKAP13-211ENST00000559362 TMF1P82094 1093 aa22.02■■□□□ 1.12
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AKAP13-211ENST00000559362 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AKAP13-211ENST00000559362 NEUROD2Q15784 382 aa21.99■■□□□ 1.11
AKAP13-211ENST00000559362 NBR1Q14596 966 aa21.97■■□□□ 1.11
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AKAP13-211ENST00000559362 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
AKAP13-211ENST00000559362 MLECQ14165 292 aa21.95■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 PKD2Q13563 968 aa21.94■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.94■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.94■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.92■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.92■■□□□ 1.1
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AKAP13-211ENST00000559362 GGT6Q6P531 493 aa21.9■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 SMARCA4P51532 1647 aa21.9■■□□□ 1.1
AKAP13-211ENST00000559362 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.89■■□□□ 1.09
AKAP13-211ENST00000559362 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
AKAP13-211ENST00000559362 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.87■■□□□ 1.09
AKAP13-211ENST00000559362 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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AKAP13-211ENST00000559362 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.86■■□□□ 1.09
AKAP13-211ENST00000559362 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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AKAP13-211ENST00000559362 ARXQ96QS3 562 aa21.84■■□□□ 1.09
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AKAP13-211ENST00000559362 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 CASC1Q6TDU7 716 aa21.81■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.8■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 MORC1Q86VD1 984 aa21.8■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 CCER2I3L3R5 266 aa21.78■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 MS4A1P11836 297 aa21.78■■□□□ 1.08
AKAP13-211ENST00000559362 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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