RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557294.5

PRKCH-223, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-223	ENST00000557294	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKCH-223	ENST00000557294	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKCH-223	ENST00000557294	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PRKCH-223	ENST00000557294	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.07	■■■□□ 2.89
PRKCH-223	ENST00000557294	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRKCH-223	ENST00000557294	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33	■■■□□ 2.87
PRKCH-223	ENST00000557294	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRKCH-223	ENST00000557294	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PRKCH-223	ENST00000557294	KDM6B	O15054	1643 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRKCH-223	ENST00000557294	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PRKCH-223	ENST00000557294	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PRKCH-223	ENST00000557294	IGF1R	P08069	1367 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PRKCH-223	ENST00000557294	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PRKCH-223	ENST00000557294	PTPRG	P23470	1445 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRKCH-223	ENST00000557294	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PRKCH-223	ENST00000557294	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PRKCH-223	ENST00000557294	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PRKCH-223	ENST00000557294	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PRKCH-223	ENST00000557294	CUL7	Q14999	1698 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PRKCH-223	ENST00000557294	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PRKCH-223	ENST00000557294	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PRKCH-223	ENST00000557294	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PRKCH-223	ENST00000557294	GLI2	P10070	1586 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PRKCH-223	ENST00000557294	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PRKCH-223	ENST00000557294	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PRKCH-223	ENST00000557294	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PRKCH-223	ENST00000557294	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PRKCH-223	ENST00000557294	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PRKCH-223	ENST00000557294	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PRKCH-223	ENST00000557294	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PRKCH-223	ENST00000557294	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRKCH-223	ENST00000557294	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRKCH-223	ENST00000557294	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRKCH-223	ENST00000557294	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRKCH-223	ENST00000557294	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRKCH-223	ENST00000557294	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PRKCH-223	ENST00000557294	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKCH-223	ENST00000557294	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-223	ENST00000557294	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCH-223	ENST00000557294	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCH-223	ENST00000557294	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKCH-223	ENST00000557294	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRKCH-223	ENST00000557294	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PRKCH-223	ENST00000557294	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PRKCH-223	ENST00000557294	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PRKCH-223	ENST00000557294	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PRKCH-223	ENST00000557294	GOLGA3	Q08378	1498 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PRKCH-223	ENST00000557294	ABCA8	O94911	1581 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PRKCH-223	ENST00000557294	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PRKCH-223	ENST00000557294	KIF21B	O75037	1637 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PRKCH-223	ENST00000557294	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PRKCH-223	ENST00000557294	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PRKCH-223	ENST00000557294	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PRKCH-223	ENST00000557294	PTPRM	P28827	1452 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PRKCH-223	ENST00000557294	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PRKCH-223	ENST00000557294	ATP10B	O94823	1461 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PRKCH-223	ENST00000557294	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PRKCH-223	ENST00000557294	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.64	■■■□□ 2.65
PRKCH-223	ENST00000557294	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PRKCH-223	ENST00000557294	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PRKCH-223	ENST00000557294	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PRKCH-223	ENST00000557294	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PRKCH-223	ENST00000557294	NEO1	Q92859	1461 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PRKCH-223	ENST00000557294	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PRKCH-223	ENST00000557294	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PRKCH-223	ENST00000557294	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PRKCH-223	ENST00000557294	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
PRKCH-223	ENST00000557294	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
PRKCH-223	ENST00000557294	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PRKCH-223	ENST00000557294	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.39	■■■□□ 2.61
PRKCH-223	ENST00000557294	HSPA2	P54652	639 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PRKCH-223	ENST00000557294	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	SAMD9	Q5K651	1589 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.26	■■■□□ 2.6
PRKCH-223	ENST00000557294	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PRKCH-223	ENST00000557294	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PRKCH-223	ENST00000557294	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PRKCH-223	ENST00000557294	FANCA	O15360	1455 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PRKCH-223	ENST00000557294	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PRKCH-223	ENST00000557294	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.14	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	MLEC	Q14165	292 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.11	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PRKCH-223	ENST00000557294	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PRKCH-223	ENST00000557294	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PRKCH-223	ENST00000557294	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PRKCH-223	ENST00000557294	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31	■■■□□ 2.55
PRKCH-223	ENST00000557294	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		30.99	■■■□□ 2.55

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