RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555037.1

PSMA3-AS1-206, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 446 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.35□□□□□ -0.27
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.32□□□□□ -0.28
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.26□□□□□ -0.29
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 NCAPD3P42695 1498 aa13.17□□□□□ -0.3
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 GABBR2O75899 941 aa13.15□□□□□ -0.3
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 KLHL34Q8N239 644 aa13.15□□□□□ -0.3
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.13□□□□□ -0.31
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SMARCA4P51532 1647 aa13.1□□□□□ -0.31
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CLCN6P51797 869 aa13.1□□□□□ -0.31
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 RASEFQ8IZ41 740 aa13.1□□□□□ -0.31
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PHF12Q96QT6 1004 aa13.09□□□□□ -0.31
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 NUBP1P53384 320 aa13.07□□□□□ -0.32
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.07□□□□□ -0.32
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SMARCA2P51531 1590 aa13.05□□□□□ -0.32
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 FAM212AQ96EL1 285 aa13.04□□□□□ -0.32
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.03□□□□□ -0.32
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.02□□□□□ -0.33
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 HMGXB3Q12766 1538 aa13□□□□□ -0.33
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.98□□□□□ -0.33
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SPOCK2Q92563 424 aa12.95□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.95□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 MS4A3Q96HJ5 214 aa12.93□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 KIF12Q96FN5 646 aa12.92□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 GSE1Q14687 1217 aa12.9□□□□□ -0.34
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 MAP3K13O43283 966 aa12.88□□□□□ -0.35
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 WIZO95785 1651 aa12.86□□□□□ -0.35
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PYGBP11216 843 aa12.84□□□□□ -0.35
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.84□□□□□ -0.35
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 POTEIP0CG38 1075 aa12.83□□□□□ -0.36
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 NESP48681 1621 aa12.8□□□□□ -0.36
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.8□□□□□ -0.36
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.78□□□□□ -0.36
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 IFNL1Q8IU54 200 aa12.74□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TRPC6Q9Y210 931 aa12.74□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.72□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ERCC6Q03468 1493 aa12.72□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TIE1P35590 1138 aa12.71□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.7□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.68□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CFTRP13569 1480 aa12.67□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TRIM41Q8WV44 630 aa12.66□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.65□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.65□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CUX2O14529 1486 aa12.65□□□□□ -0.38
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SLC39A7Q92504 469 aa12.63□□□□□ -0.39
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.63□□□□□ -0.39
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 METRNQ9UJH8 293 aa12.6□□□□□ -0.39
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 LHX8Q68G74 356 aa12.59□□□□□ -0.39
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.59□□□□□ -0.39
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 C7P10643 843 aa12.58□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.57□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.53□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PSEN1P49768 467 aa12.53□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.53□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.52□□□□□ -0.4
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 WDR62O43379 1518 aa12.49□□□□□ -0.41
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 SEC24BO95487 1268 aa12.49□□□□□ -0.41
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 GOLGA2Q08379 1002 aa12.49□□□□□ -0.41
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 IER5LQ5T953 404 aa12.48□□□□□ -0.41
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.44□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 POTEB2H3BUK9 544 aa12.43□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PKD2Q13563 968 aa12.43□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 PLCG2P16885 1265 aa12.42□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 POTEFA5A3E0 1075 aa12.4□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 CABP2Q9NPB3 220 aa12.4□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.4□□□□□ -0.42
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ABCC8Q09428 1581 aa12.37□□□□□ -0.43
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PSMA3-AS1-206ENST00000555037 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 880.1 ms