RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549655.5

BRF1-215, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
BRF1-215	ENST00000549655	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.32	■■■□□ 2.28
BRF1-215	ENST00000549655	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.3	■■■□□ 2.28
BRF1-215	ENST00000549655	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		29.29	■■■□□ 2.28
BRF1-215	ENST00000549655	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.27	■■■□□ 2.28
BRF1-215	ENST00000549655	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.27	■■■□□ 2.28
BRF1-215	ENST00000549655	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
BRF1-215	ENST00000549655	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		29.22	■■■□□ 2.27
BRF1-215	ENST00000549655	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
BRF1-215	ENST00000549655	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
BRF1-215	ENST00000549655	MAP3K1	Q13233	1512 aa		29.15	■■■□□ 2.26
BRF1-215	ENST00000549655	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.13	■■■□□ 2.25
BRF1-215	ENST00000549655	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
BRF1-215	ENST00000549655	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.12	■■■□□ 2.25
BRF1-215	ENST00000549655	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.11	■■■□□ 2.25
BRF1-215	ENST00000549655	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
BRF1-215	ENST00000549655	FMN1	Q68DA7	1419 aa		29.07	■■■□□ 2.24
BRF1-215	ENST00000549655	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.06	■■■□□ 2.24
BRF1-215	ENST00000549655	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.05	■■■□□ 2.24
BRF1-215	ENST00000549655	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.05	■■■□□ 2.24
BRF1-215	ENST00000549655	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
BRF1-215	ENST00000549655	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
BRF1-215	ENST00000549655	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
BRF1-215	ENST00000549655	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
BRF1-215	ENST00000549655	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29	■■■□□ 2.23
BRF1-215	ENST00000549655	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29	■■■□□ 2.23
BRF1-215	ENST00000549655	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.98	■■■□□ 2.23
BRF1-215	ENST00000549655	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
BRF1-215	ENST00000549655	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.92	■■■□□ 2.22
BRF1-215	ENST00000549655	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.92	■■■□□ 2.22
BRF1-215	ENST00000549655	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
BRF1-215	ENST00000549655	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.9	■■■□□ 2.22
BRF1-215	ENST00000549655	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.86	■■■□□ 2.21
BRF1-215	ENST00000549655	FBLN2	P98095	1184 aa		28.82	■■■□□ 2.2
BRF1-215	ENST00000549655	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.8	■■■□□ 2.2
BRF1-215	ENST00000549655	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.8	■■■□□ 2.2
BRF1-215	ENST00000549655	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.79	■■■□□ 2.2
BRF1-215	ENST00000549655	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.75	■■■□□ 2.19
BRF1-215	ENST00000549655	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.74	■■■□□ 2.19
BRF1-215	ENST00000549655	NUP160	Q12769	1436 aa		28.74	■■■□□ 2.19
BRF1-215	ENST00000549655	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.71	■■■□□ 2.19
BRF1-215	ENST00000549655	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.7	■■■□□ 2.18
BRF1-215	ENST00000549655	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.68	■■■□□ 2.18
BRF1-215	ENST00000549655	ITGAE	P38570	1179 aa		28.62	■■■□□ 2.17
BRF1-215	ENST00000549655	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
BRF1-215	ENST00000549655	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.61	■■■□□ 2.17
BRF1-215	ENST00000549655	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.61	■■■□□ 2.17
BRF1-215	ENST00000549655	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
BRF1-215	ENST00000549655	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.57	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.55	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.53	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.53	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.52	■■■□□ 2.16
BRF1-215	ENST00000549655	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.5	■■■□□ 2.15
BRF1-215	ENST00000549655	CHD1	O14646	1710 aa		28.5	■■■□□ 2.15
BRF1-215	ENST00000549655	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
BRF1-215	ENST00000549655	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28.48	■■■□□ 2.15
BRF1-215	ENST00000549655	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.47	■■■□□ 2.15
BRF1-215	ENST00000549655	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
BRF1-215	ENST00000549655	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.42	■■■□□ 2.14
BRF1-215	ENST00000549655	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.39	■■■□□ 2.14
BRF1-215	ENST00000549655	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.38	■■■□□ 2.13
BRF1-215	ENST00000549655	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.37	■■■□□ 2.13
BRF1-215	ENST00000549655	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
BRF1-215	ENST00000549655	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
BRF1-215	ENST00000549655	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.33	■■■□□ 2.13
BRF1-215	ENST00000549655	ABCA8	O94911	1581 aa		28.29	■■■□□ 2.12
BRF1-215	ENST00000549655	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
BRF1-215	ENST00000549655	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.26	■■■□□ 2.12
BRF1-215	ENST00000549655	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.26	■■■□□ 2.11
BRF1-215	ENST00000549655	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.25	■■■□□ 2.11
BRF1-215	ENST00000549655	PTPRG	P23470	1445 aa		28.24	■■■□□ 2.11
BRF1-215	ENST00000549655	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
BRF1-215	ENST00000549655	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.16	■■■□□ 2.1
BRF1-215	ENST00000549655	ATP10B	O94823	1461 aa		28.16	■■■□□ 2.1
BRF1-215	ENST00000549655	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.13	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.13	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.11	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.11	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.11	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	KIF14	Q15058	1648 aa		28.1	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	NAIP	Q13075	1403 aa		28.09	■■■□□ 2.09
BRF1-215	ENST00000549655	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.07	■■■□□ 2.08
BRF1-215	ENST00000549655	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.04	■■■□□ 2.08
BRF1-215	ENST00000549655	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.04	■■■□□ 2.08
BRF1-215	ENST00000549655	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
BRF1-215	ENST00000549655	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	DAPK1	P53355	1430 aa		27.99	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.98	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	ABCC5	O15440	1437 aa		27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-215	ENST00000549655	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.96	■■■□□ 2.07

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