RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRU-210ENST00000527027 IGF1RP08069 1367 aa28.38■■■□□ 2.13
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PTPRU-210ENST00000527027 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRU-210ENST00000527027 KIF27Q86VH2 1401 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRU-210ENST00000527027 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRU-210ENST00000527027 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.3■■■□□ 2.12
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PTPRU-210ENST00000527027 CUL7Q14999 1698 aa28.2■■■□□ 2.11
PTPRU-210ENST00000527027 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRU-210ENST00000527027 PTPRGP23470 1445 aa28.15■■■□□ 2.1
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PTPRU-210ENST00000527027 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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PTPRU-210ENST00000527027 ABCC2Q92887 1545 aa27.97■■■□□ 2.07
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PTPRU-210ENST00000527027 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.37■■□□□ 1.97
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PTPRU-210ENST00000527027 ATP10BO94823 1461 aa27.32■■□□□ 1.96
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PTPRU-210ENST00000527027 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.25■■□□□ 1.95
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PTPRU-210ENST00000527027 KIF21BO75037 1637 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRU-210ENST00000527027 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRU-210ENST00000527027 NEO1Q92859 1461 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-210ENST00000527027 EEA1Q15075 1411 aa27.08■■□□□ 1.93
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PTPRU-210ENST00000527027 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRU-210ENST00000527027 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRU-210ENST00000527027 PTPRMP28827 1452 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRU-210ENST00000527027 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.95■■□□□ 1.9
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PTPRU-210ENST00000527027 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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PTPRU-210ENST00000527027 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
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PTPRU-210ENST00000527027 FBXO41Q8TF61 875 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-210ENST00000527027 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRU-210ENST00000527027 RICTORQ6R327 1708 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRU-210ENST00000527027 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.76■■□□□ 1.87
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PTPRU-210ENST00000527027 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 PLCH2O75038 1416 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRU-210ENST00000527027 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PTPRU-210ENST00000527027 FMN1Q68DA7 1419 aa26.7■■□□□ 1.86
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