RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSC-AS1-202ENST00000512290 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.18□□□□□ -0.14
MSC-AS1-202ENST00000512290 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.18□□□□□ -0.14
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SPOCK2Q92563 424 aa14.12□□□□□ -0.15
MSC-AS1-202ENST00000512290 IER5LQ5T953 404 aa14.11□□□□□ -0.15
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MSC-AS1-202ENST00000512290 CFTRP13569 1480 aa13.99□□□□□ -0.17
MSC-AS1-202ENST00000512290 WIZO95785 1651 aa13.99□□□□□ -0.17
MSC-AS1-202ENST00000512290 IFT140Q96RY7 1462 aa13.98□□□□□ -0.17
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARAP1Q96P48 1450 aa13.95□□□□□ -0.18
MSC-AS1-202ENST00000512290 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
MSC-AS1-202ENST00000512290 GOLGA2Q08379 1002 aa13.94□□□□□ -0.18
MSC-AS1-202ENST00000512290 OCEL1Q9H607 264 aa13.94□□□□□ -0.18
MSC-AS1-202ENST00000512290 PSEN1P49768 467 aa13.93□□□□□ -0.18
MSC-AS1-202ENST00000512290 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
MSC-AS1-202ENST00000512290 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
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