RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PDE4D-218ENST00000509368 METRNQ9UJH8 293 aa5.21□□□□□ -1.57
PDE4D-218ENST00000509368 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PDE4D-218ENST00000509368 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PDE4D-218ENST00000509368 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PDE4D-218ENST00000509368 SNPHO15079 494 aa5.13□□□□□ -1.59
PDE4D-218ENST00000509368 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.12□□□□□ -1.59
PDE4D-218ENST00000509368 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PDE4D-218ENST00000509368 POTEJP0CG39 1038 aa5.1□□□□□ -1.59
PDE4D-218ENST00000509368 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PDE4D-218ENST00000509368 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-218ENST00000509368 ST18O60284 1047 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-218ENST00000509368 PROM2Q8N271 834 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-218ENST00000509368 STAG3Q9UJ98 1225 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-218ENST00000509368 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PDE4D-218ENST00000509368 IER5LQ5T953 404 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-218ENST00000509368 PHF12Q96QT6 1004 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-218ENST00000509368 PTGER2P43116 358 aa4.96□□□□□ -1.61
PDE4D-218ENST00000509368 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 SEC24BO95487 1268 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 TIE1P35590 1138 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A3Q96HJ5 214 aa4.93□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 CREBZFQ9NS37 354 aa4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PDE4D-218ENST00000509368 POTEFA5A3E0 1075 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-218ENST00000509368 RGS20O76081 388 aa4.88□□□□□ -1.63
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO3Q9UK99 471 aa4.87□□□□□ -1.63
PDE4D-218ENST00000509368 EMP3P54852 163 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-218ENST00000509368 MIER1Q8N108 512 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 PKD2Q13563 968 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 PLCB2Q00722 1185 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL34Q8N239 644 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.8□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 PLCG2P16885 1265 aa4.79□□□□□ -1.64
PDE4D-218ENST00000509368 BCANQ96GW7 911 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 KIF12Q96FN5 646 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 VSIG10Q8N0Z9 540 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 RASEFQ8IZ41 740 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 NUBP1P53384 320 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 RGL2O15211 777 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 SPOCK2Q92563 424 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 MARVELD3Q96A59 401 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 FAM205CA6NFA0 338 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC61Q9Y6R9 512 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF8L2P0C7V8 631 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 PYGBP11216 843 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 OCEL1Q9H607 264 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 POTEB3A0JP26 581 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 POTEBQ6S5H4 581 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 HCSTQ9UBK5 93 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF8Q5TAQ9 597 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 TAOK2Q9UL54 1235 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHG5O94827 1062 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 ERBB3P21860 1342 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 FAM212AQ96EL1 285 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 IFFO2Q5TF58 517 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 MAP3K13O43283 966 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 CHGAP10645 457 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 ERICH6Q7L0X2 663 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 TRPC6Q9Y210 931 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 DOK7Q18PE1 504 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 RIMBP2O15034 1052 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-218ENST00000509368 GSE1Q14687 1217 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 IFNL1Q8IU54 200 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms