RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501938.6

RGMB-AS1-202, RGMB antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RGMB-AS1, Length 2,034 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMB-AS1-202ENST00000501938 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.38■■■□□ 2.61
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.31■■■□□ 2.6
RGMB-AS1-202ENST00000501938 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
RGMB-AS1-202ENST00000501938 P3H3Q8IVL6 736 aa31.27■■■□□ 2.6
RGMB-AS1-202ENST00000501938 GRIN2AQ12879 1464 aa31.24■■■□□ 2.59
RGMB-AS1-202ENST00000501938 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
RGMB-AS1-202ENST00000501938 SYNJ2O15056 1496 aa31.21■■■□□ 2.59
RGMB-AS1-202ENST00000501938 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
RGMB-AS1-202ENST00000501938 FBLN2P98095 1184 aa31.19■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-202ENST00000501938 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.16■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-202ENST00000501938 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.14■■■□□ 2.58
RGMB-AS1-202ENST00000501938 IQGAP2Q13576 1575 aa31.13■■■□□ 2.57
RGMB-AS1-202ENST00000501938 SAMD9Q5K651 1589 aa31.1■■■□□ 2.57
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CEP170Q5SW79 1584 aa31.1■■■□□ 2.57
RGMB-AS1-202ENST00000501938 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.05■■■□□ 2.56
RGMB-AS1-202ENST00000501938 APLP2Q06481 763 aa31.03■■■□□ 2.56
RGMB-AS1-202ENST00000501938 NUP160Q12769 1436 aa31■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-202ENST00000501938 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.96■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CHD1O14646 1710 aa30.96■■■□□ 2.55
RGMB-AS1-202ENST00000501938 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
RGMB-AS1-202ENST00000501938 DISP1Q96F81 1524 aa30.88■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-202ENST00000501938 FMN1Q68DA7 1419 aa30.88■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.85■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-202ENST00000501938 KIAA0556O60303 1618 aa30.84■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-202ENST00000501938 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.83■■■□□ 2.53
RGMB-AS1-202ENST00000501938 TIAM1Q13009 1591 aa30.82■■■□□ 2.52
RGMB-AS1-202ENST00000501938 JPH4Q96JJ6 628 aa30.81■■■□□ 2.52
RGMB-AS1-202ENST00000501938 MAP3K1Q13233 1512 aa30.75■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-202ENST00000501938 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.75■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.74■■■□□ 2.51
RGMB-AS1-202ENST00000501938 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.69■■■□□ 2.5
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.63■■■□□ 2.49
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ARID3CA6NKF2 412 aa30.58■■■□□ 2.49
RGMB-AS1-202ENST00000501938 HECW1Q76N89 1606 aa30.58■■■□□ 2.49
RGMB-AS1-202ENST00000501938 SHROOM2Q13796 1616 aa30.57■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.55■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.53■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.53■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.52■■■□□ 2.48
RGMB-AS1-202ENST00000501938 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-202ENST00000501938 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.49■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.48■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.47■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-202ENST00000501938 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.46■■■□□ 2.47
RGMB-AS1-202ENST00000501938 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-202ENST00000501938 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PTPRGP23470 1445 aa30.39■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ABCA8O94911 1581 aa30.39■■■□□ 2.46
RGMB-AS1-202ENST00000501938 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.37■■■□□ 2.45
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.36■■■□□ 2.45
RGMB-AS1-202ENST00000501938 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-202ENST00000501938 NCOA2Q15596 1464 aa30.32■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-202ENST00000501938 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-202ENST00000501938 HRCP23327 699 aa30.29■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-202ENST00000501938 OSCARQ8IYS5 282 aa30.27■■■□□ 2.44
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ARHGEF11O15085 1522 aa30.24■■■□□ 2.43
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ATP10BO94823 1461 aa30.23■■■□□ 2.43
RGMB-AS1-202ENST00000501938 UACAQ9BZF9 1416 aa30.21■■■□□ 2.43
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ITGAEP38570 1179 aa30.21■■■□□ 2.43
RGMB-AS1-202ENST00000501938 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-202ENST00000501938 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.19■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-202ENST00000501938 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.17■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-202ENST00000501938 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ABCC2Q92887 1545 aa30.11■■■□□ 2.41
RGMB-AS1-202ENST00000501938 KIF14Q15058 1648 aa30.1■■■□□ 2.41
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.05■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.04■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.03■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-202ENST00000501938 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
RGMB-AS1-202ENST00000501938 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.99■■■□□ 2.39
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
RGMB-AS1-202ENST00000501938 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
RGMB-AS1-202ENST00000501938 PTPRKQ15262 1439 aa29.94■■■□□ 2.38
RGMB-AS1-202ENST00000501938 MIA2Q96PC5 1412 aa29.94■■■□□ 2.38
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.92■■■□□ 2.38
RGMB-AS1-202ENST00000501938 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.92■■■□□ 2.38
RGMB-AS1-202ENST00000501938 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.86■■■□□ 2.37
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.85■■■□□ 2.37
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
RGMB-AS1-202ENST00000501938 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.82■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.81■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 KCNH8Q96L42 1107 aa29.8■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.78■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.77■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.76■■■□□ 2.36
RGMB-AS1-202ENST00000501938 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
RGMB-AS1-202ENST00000501938 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms