RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497637.5

ACTN4-208, Transcript of actinin alpha 4, human

TSL 2

Gene ACTN4, Length 877 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN4-208	ENST00000497637	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.41	■■■□□ 2.94
ACTN4-208	ENST00000497637	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
ACTN4-208	ENST00000497637	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ACTN4-208	ENST00000497637	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ACTN4-208	ENST00000497637	KDM6B	O15054	1643 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ACTN4-208	ENST00000497637	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ACTN4-208	ENST00000497637	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ACTN4-208	ENST00000497637	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ACTN4-208	ENST00000497637	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ACTN4-208	ENST00000497637	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ACTN4-208	ENST00000497637	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ACTN4-208	ENST00000497637	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ACTN4-208	ENST00000497637	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ACTN4-208	ENST00000497637	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACTN4-208	ENST00000497637	PTPRG	P23470	1445 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ACTN4-208	ENST00000497637	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.76	■■■□□ 2.84
ACTN4-208	ENST00000497637	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.76	■■■□□ 2.84
ACTN4-208	ENST00000497637	GLI2	P10070	1586 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACTN4-208	ENST00000497637	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ACTN4-208	ENST00000497637	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ACTN4-208	ENST00000497637	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	IGF1R	P08069	1367 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ACTN4-208	ENST00000497637	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ACTN4-208	ENST00000497637	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ACTN4-208	ENST00000497637	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ACTN4-208	ENST00000497637	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ACTN4-208	ENST00000497637	CUL7	Q14999	1698 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ACTN4-208	ENST00000497637	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ACTN4-208	ENST00000497637	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ACTN4-208	ENST00000497637	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ACTN4-208	ENST00000497637	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ACTN4-208	ENST00000497637	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ACTN4-208	ENST00000497637	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ACTN4-208	ENST00000497637	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
ACTN4-208	ENST00000497637	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ACTN4-208	ENST00000497637	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ACTN4-208	ENST00000497637	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ACTN4-208	ENST00000497637	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ACTN4-208	ENST00000497637	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
ACTN4-208	ENST00000497637	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ACTN4-208	ENST00000497637	PTPRM	P28827	1452 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ACTN4-208	ENST00000497637	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ACTN4-208	ENST00000497637	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ACTN4-208	ENST00000497637	KIF21B	O75037	1637 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ACTN4-208	ENST00000497637	KIAA0556	O60303	1618 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ACTN4-208	ENST00000497637	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ACTN4-208	ENST00000497637	EEA1	Q15075	1411 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ACTN4-208	ENST00000497637	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ACTN4-208	ENST00000497637	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ACTN4-208	ENST00000497637	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ACTN4-208	ENST00000497637	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
ACTN4-208	ENST00000497637	GOLGA3	Q08378	1498 aa		31.82	■■■□□ 2.68
ACTN4-208	ENST00000497637	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
ACTN4-208	ENST00000497637	ABCA8	O94911	1581 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ACTN4-208	ENST00000497637	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ACTN4-208	ENST00000497637	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ACTN4-208	ENST00000497637	SOCS7	O14512	581 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ACTN4-208	ENST00000497637	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.73	■■■□□ 2.67
ACTN4-208	ENST00000497637	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.67	■■■□□ 2.66
ACTN4-208	ENST00000497637	NEO1	Q92859	1461 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ACTN4-208	ENST00000497637	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ACTN4-208	ENST00000497637	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ACTN4-208	ENST00000497637	HSPA2	P54652	639 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ACTN4-208	ENST00000497637	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ACTN4-208	ENST00000497637	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ACTN4-208	ENST00000497637	ATP10B	O94823	1461 aa		31.57	■■■□□ 2.64
ACTN4-208	ENST00000497637	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ACTN4-208	ENST00000497637	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ACTN4-208	ENST00000497637	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ACTN4-208	ENST00000497637	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.51	■■■□□ 2.64
ACTN4-208	ENST00000497637	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
ACTN4-208	ENST00000497637	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ACTN4-208	ENST00000497637	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ACTN4-208	ENST00000497637	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ACTN4-208	ENST00000497637	FANCA	O15360	1455 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ACTN4-208	ENST00000497637	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
ACTN4-208	ENST00000497637	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ACTN4-208	ENST00000497637	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ACTN4-208	ENST00000497637	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
ACTN4-208	ENST00000497637	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
ACTN4-208	ENST00000497637	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ACTN4-208	ENST00000497637	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ACTN4-208	ENST00000497637	PRX	Q9BXM0	1461 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ACTN4-208	ENST00000497637	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
ACTN4-208	ENST00000497637	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ACTN4-208	ENST00000497637	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ACTN4-208	ENST00000497637	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	MLEC	Q14165	292 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ACTN4-208	ENST00000497637	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.21	■■■□□ 2.59

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