RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494191.6

CROCC-211, Transcript of ciliary rootlet coiled-coil, rootletin, human

TSL 5

Gene CROCC, Length 1,996 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CROCC-211	ENST00000494191	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CROCC-211	ENST00000494191	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CROCC-211	ENST00000494191	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
CROCC-211	ENST00000494191	ADAMTS12	P58397	1594 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CROCC-211	ENST00000494191	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.51	■■■□□ 2.95
CROCC-211	ENST00000494191	HRC	P23327	699 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CROCC-211	ENST00000494191	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CROCC-211	ENST00000494191	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CROCC-211	ENST00000494191	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CROCC-211	ENST00000494191	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
CROCC-211	ENST00000494191	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CROCC-211	ENST00000494191	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CROCC-211	ENST00000494191	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CROCC-211	ENST00000494191	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
CROCC-211	ENST00000494191	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CROCC-211	ENST00000494191	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
CROCC-211	ENST00000494191	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
CROCC-211	ENST00000494191	SYNJ2	O15056	1496 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	FBLN2	P98095	1184 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CROCC-211	ENST00000494191	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CROCC-211	ENST00000494191	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CROCC-211	ENST00000494191	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CROCC-211	ENST00000494191	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CROCC-211	ENST00000494191	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CROCC-211	ENST00000494191	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
CROCC-211	ENST00000494191	NUP160	Q12769	1436 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CROCC-211	ENST00000494191	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CROCC-211	ENST00000494191	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CROCC-211	ENST00000494191	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CROCC-211	ENST00000494191	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CROCC-211	ENST00000494191	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CROCC-211	ENST00000494191	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
CROCC-211	ENST00000494191	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CROCC-211	ENST00000494191	CHD1	O14646	1710 aa		32.82	■■■□□ 2.85
CROCC-211	ENST00000494191	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CROCC-211	ENST00000494191	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CROCC-211	ENST00000494191	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CROCC-211	ENST00000494191	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CROCC-211	ENST00000494191	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CROCC-211	ENST00000494191	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CROCC-211	ENST00000494191	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CROCC-211	ENST00000494191	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CROCC-211	ENST00000494191	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CROCC-211	ENST00000494191	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
CROCC-211	ENST00000494191	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CROCC-211	ENST00000494191	ITGAE	P38570	1179 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CROCC-211	ENST00000494191	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CROCC-211	ENST00000494191	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CROCC-211	ENST00000494191	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CROCC-211	ENST00000494191	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CROCC-211	ENST00000494191	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CROCC-211	ENST00000494191	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CROCC-211	ENST00000494191	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
CROCC-211	ENST00000494191	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CROCC-211	ENST00000494191	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CROCC-211	ENST00000494191	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CROCC-211	ENST00000494191	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CROCC-211	ENST00000494191	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CROCC-211	ENST00000494191	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.42	■■■□□ 2.78
CROCC-211	ENST00000494191	ABCA8	O94911	1581 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CROCC-211	ENST00000494191	PTPRG	P23470	1445 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CROCC-211	ENST00000494191	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
CROCC-211	ENST00000494191	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CROCC-211	ENST00000494191	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CROCC-211	ENST00000494191	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CROCC-211	ENST00000494191	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
CROCC-211	ENST00000494191	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.27	■■■□□ 2.76
CROCC-211	ENST00000494191	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CROCC-211	ENST00000494191	ATP10B	O94823	1461 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CROCC-211	ENST00000494191	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
CROCC-211	ENST00000494191	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
CROCC-211	ENST00000494191	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.21	■■■□□ 2.75
CROCC-211	ENST00000494191	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.2	■■■□□ 2.74
CROCC-211	ENST00000494191	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CROCC-211	ENST00000494191	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CROCC-211	ENST00000494191	KIF14	Q15058	1648 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CROCC-211	ENST00000494191	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CROCC-211	ENST00000494191	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CROCC-211	ENST00000494191	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.05	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
CROCC-211	ENST00000494191	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CROCC-211	ENST00000494191	NAIP	Q13075	1403 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CROCC-211	ENST00000494191	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CROCC-211	ENST00000494191	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CROCC-211	ENST00000494191	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.96	■■■□□ 2.71
CROCC-211	ENST00000494191	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
CROCC-211	ENST00000494191	DAPK1	P53355	1430 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CROCC-211	ENST00000494191	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CROCC-211	ENST00000494191	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
CROCC-211	ENST00000494191	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.91	■■■□□ 2.7

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