RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494126.6

PHYKPL-211, Transcript of 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHYKPL, Length 2,297 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYKPL-211ENST00000494126 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
PHYKPL-211ENST00000494126 GRIN2BQ13224 1484 aa38.1■■■■□ 3.69
PHYKPL-211ENST00000494126 ADAMTS12P58397 1594 aa38.08■■■■□ 3.69
PHYKPL-211ENST00000494126 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.06■■■■□ 3.68
PHYKPL-211ENST00000494126 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.05■■■■□ 3.68
PHYKPL-211ENST00000494126 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
PHYKPL-211ENST00000494126 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.91■■■■□ 3.66
PHYKPL-211ENST00000494126 P3H3Q8IVL6 736 aa37.89■■■■□ 3.66
PHYKPL-211ENST00000494126 SAMD9Q5K651 1589 aa37.87■■■■□ 3.65
PHYKPL-211ENST00000494126 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
PHYKPL-211ENST00000494126 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.85■■■■□ 3.65
PHYKPL-211ENST00000494126 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
PHYKPL-211ENST00000494126 MAP3K1Q13233 1512 aa37.83■■■■□ 3.65
PHYKPL-211ENST00000494126 TIAM1Q13009 1591 aa37.8■■■■□ 3.64
PHYKPL-211ENST00000494126 IQGAP2Q13576 1575 aa37.75■■■■□ 3.63
PHYKPL-211ENST00000494126 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.72■■■■□ 3.63
PHYKPL-211ENST00000494126 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
PHYKPL-211ENST00000494126 FMN1Q68DA7 1419 aa37.71■■■■□ 3.63
PHYKPL-211ENST00000494126 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.7■■■■□ 3.63
PHYKPL-211ENST00000494126 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.69■■■■□ 3.62
PHYKPL-211ENST00000494126 GRIN2AQ12879 1464 aa37.68■■■■□ 3.62
PHYKPL-211ENST00000494126 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
PHYKPL-211ENST00000494126 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.61■■■■□ 3.61
PHYKPL-211ENST00000494126 SYNJ2O15056 1496 aa37.59■■■■□ 3.61
PHYKPL-211ENST00000494126 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.57■■■■□ 3.6
PHYKPL-211ENST00000494126 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
PHYKPL-211ENST00000494126 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.56■■■■□ 3.6
PHYKPL-211ENST00000494126 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
PHYKPL-211ENST00000494126 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PHYKPL-211ENST00000494126 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
PHYKPL-211ENST00000494126 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
PHYKPL-211ENST00000494126 CEP170Q5SW79 1584 aa37.45■■■■□ 3.59
PHYKPL-211ENST00000494126 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
PHYKPL-211ENST00000494126 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.42■■■■□ 3.58
PHYKPL-211ENST00000494126 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.39■■■■□ 3.58
PHYKPL-211ENST00000494126 KIAA0556O60303 1618 aa37.37■■■■□ 3.57
PHYKPL-211ENST00000494126 DISP1Q96F81 1524 aa37.37■■■■□ 3.57
PHYKPL-211ENST00000494126 NUP160Q12769 1436 aa37.37■■■■□ 3.57
PHYKPL-211ENST00000494126 FBLN2P98095 1184 aa37.34■■■■□ 3.57
PHYKPL-211ENST00000494126 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.33■■■■□ 3.57
PHYKPL-211ENST00000494126 HECW1Q76N89 1606 aa37.29■■■■□ 3.56
PHYKPL-211ENST00000494126 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.24■■■■□ 3.55
PHYKPL-211ENST00000494126 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.21■■■■□ 3.55
PHYKPL-211ENST00000494126 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.16■■■■□ 3.54
PHYKPL-211ENST00000494126 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PHYKPL-211ENST00000494126 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.11■■■■□ 3.53
PHYKPL-211ENST00000494126 JPH4Q96JJ6 628 aa37.09■■■■□ 3.53
PHYKPL-211ENST00000494126 CHD1O14646 1710 aa37.08■■■■□ 3.53
PHYKPL-211ENST00000494126 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
PHYKPL-211ENST00000494126 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
PHYKPL-211ENST00000494126 NCOA2Q15596 1464 aa37.06■■■■□ 3.52
PHYKPL-211ENST00000494126 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.05■■■■□ 3.52
PHYKPL-211ENST00000494126 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.05■■■■□ 3.52
PHYKPL-211ENST00000494126 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
PHYKPL-211ENST00000494126 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.01■■■■□ 3.51
PHYKPL-211ENST00000494126 ITGAEP38570 1179 aa37■■■■□ 3.51
PHYKPL-211ENST00000494126 ARHGEF11O15085 1522 aa37■■■■□ 3.51
PHYKPL-211ENST00000494126 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
PHYKPL-211ENST00000494126 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PHYKPL-211ENST00000494126 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.94■■■■□ 3.5
PHYKPL-211ENST00000494126 ARID3CA6NKF2 412 aa36.9■■■■□ 3.5
PHYKPL-211ENST00000494126 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.9■■■■□ 3.5
PHYKPL-211ENST00000494126 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
PHYKPL-211ENST00000494126 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PHYKPL-211ENST00000494126 SHROOM2Q13796 1616 aa36.79■■■■□ 3.48
PHYKPL-211ENST00000494126 ABCA8O94911 1581 aa36.79■■■■□ 3.48
PHYKPL-211ENST00000494126 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.77■■■■□ 3.48
PHYKPL-211ENST00000494126 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.77■■■■□ 3.48
PHYKPL-211ENST00000494126 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.76■■■■□ 3.47
PHYKPL-211ENST00000494126 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.71■■■■□ 3.47
PHYKPL-211ENST00000494126 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
PHYKPL-211ENST00000494126 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
PHYKPL-211ENST00000494126 MIA2Q96PC5 1412 aa36.66■■■■□ 3.46
PHYKPL-211ENST00000494126 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
PHYKPL-211ENST00000494126 PTPRKQ15262 1439 aa36.65■■■■□ 3.46
PHYKPL-211ENST00000494126 PTPRGP23470 1445 aa36.64■■■■□ 3.46
PHYKPL-211ENST00000494126 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.63■■■■□ 3.45
PHYKPL-211ENST00000494126 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.58■■■■□ 3.45
PHYKPL-211ENST00000494126 ATP10BO94823 1461 aa36.56■■■■□ 3.44
PHYKPL-211ENST00000494126 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.55■■■■□ 3.44
PHYKPL-211ENST00000494126 HFM1A2PYH4 1435 aa36.52■■■■□ 3.44
PHYKPL-211ENST00000494126 KIF14Q15058 1648 aa36.52■■■■□ 3.44
PHYKPL-211ENST00000494126 MAPKBP1O60336 1514 aa36.46■■■■□ 3.43
PHYKPL-211ENST00000494126 UACAQ9BZF9 1416 aa36.45■■■■□ 3.43
PHYKPL-211ENST00000494126 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.43■■■■□ 3.42
PHYKPL-211ENST00000494126 NAIPQ13075 1403 aa36.43■■■■□ 3.42
PHYKPL-211ENST00000494126 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.41■■■■□ 3.42
PHYKPL-211ENST00000494126 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PHYKPL-211ENST00000494126 AKNAQ7Z591 1439 aa36.35■■■■□ 3.41
PHYKPL-211ENST00000494126 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PHYKPL-211ENST00000494126 ABCC2Q92887 1545 aa36.34■■■■□ 3.41
PHYKPL-211ENST00000494126 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.33■■■■□ 3.41
PHYKPL-211ENST00000494126 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.33■■■■□ 3.41
PHYKPL-211ENST00000494126 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
PHYKPL-211ENST00000494126 DAPK1P53355 1430 aa36.31■■■■□ 3.4
PHYKPL-211ENST00000494126 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.29■■■■□ 3.4
PHYKPL-211ENST00000494126 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
PHYKPL-211ENST00000494126 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.28■■■■□ 3.4
PHYKPL-211ENST00000494126 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.27■■■■□ 3.4
PHYKPL-211ENST00000494126 ABCC5O15440 1437 aa36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms