RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492440.1

TTLL3-229, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,549 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-229ENST00000492440 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL3-229ENST00000492440 ADAMTS12P58397 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
TTLL3-229ENST00000492440 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
TTLL3-229ENST00000492440 MAP3K1Q13233 1512 aa24.56■■□□□ 1.52
TTLL3-229ENST00000492440 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
TTLL3-229ENST00000492440 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TTLL3-229ENST00000492440 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TTLL3-229ENST00000492440 SAMD9Q5K651 1589 aa24.47■■□□□ 1.51
TTLL3-229ENST00000492440 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-229ENST00000492440 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 TIAM1Q13009 1591 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 FMN1Q68DA7 1419 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.39■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.39■■□□□ 1.5
TTLL3-229ENST00000492440 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TTLL3-229ENST00000492440 IQGAP2Q13576 1575 aa24.37■■□□□ 1.49
TTLL3-229ENST00000492440 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TTLL3-229ENST00000492440 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.35■■□□□ 1.49
TTLL3-229ENST00000492440 GRIN2AQ12879 1464 aa24.32■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.3■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.3■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.3■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 P3H3Q8IVL6 736 aa24.3■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 SYNJ2O15056 1496 aa24.29■■□□□ 1.48
TTLL3-229ENST00000492440 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-229ENST00000492440 NUP160Q12769 1436 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-229ENST00000492440 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 CEP170Q5SW79 1584 aa24.13■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 KIAA0556O60303 1618 aa24.12■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.12■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 DISP1Q96F81 1524 aa24.11■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 HECW1Q76N89 1606 aa24.1■■□□□ 1.45
TTLL3-229ENST00000492440 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TTLL3-229ENST00000492440 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.06■■□□□ 1.44
TTLL3-229ENST00000492440 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.04■■□□□ 1.44
TTLL3-229ENST00000492440 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.04■■□□□ 1.44
TTLL3-229ENST00000492440 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
TTLL3-229ENST00000492440 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.02■■□□□ 1.44
TTLL3-229ENST00000492440 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TTLL3-229ENST00000492440 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.97■■□□□ 1.43
TTLL3-229ENST00000492440 FBLN2P98095 1184 aa23.95■■□□□ 1.43
TTLL3-229ENST00000492440 ARHGEF11O15085 1522 aa23.94■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 NCOA2Q15596 1464 aa23.92■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 JPH4Q96JJ6 628 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.89■■□□□ 1.42
TTLL3-229ENST00000492440 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.88■■□□□ 1.41
TTLL3-229ENST00000492440 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TTLL3-229ENST00000492440 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.87■■□□□ 1.41
TTLL3-229ENST00000492440 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TTLL3-229ENST00000492440 CHD1O14646 1710 aa23.83■■□□□ 1.41
TTLL3-229ENST00000492440 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TTLL3-229ENST00000492440 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TTLL3-229ENST00000492440 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
TTLL3-229ENST00000492440 SHROOM2Q13796 1616 aa23.77■■□□□ 1.4
TTLL3-229ENST00000492440 ABCA8O94911 1581 aa23.76■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 MIA2Q96PC5 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.76■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.76■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 ITGAEP38570 1179 aa23.73■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.72■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.72■■□□□ 1.39
TTLL3-229ENST00000492440 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TTLL3-229ENST00000492440 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.66■■□□□ 1.38
TTLL3-229ENST00000492440 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.65■■□□□ 1.38
TTLL3-229ENST00000492440 PTPRGP23470 1445 aa23.65■■□□□ 1.38
TTLL3-229ENST00000492440 HFM1A2PYH4 1435 aa23.63■■□□□ 1.37
TTLL3-229ENST00000492440 OSCARQ8IYS5 282 aa23.62■■□□□ 1.37
TTLL3-229ENST00000492440 PTPRKQ15262 1439 aa23.61■■□□□ 1.37
TTLL3-229ENST00000492440 ARID3CA6NKF2 412 aa23.6■■□□□ 1.37
TTLL3-229ENST00000492440 AKNAQ7Z591 1439 aa23.6■■□□□ 1.37
TTLL3-229ENST00000492440 ATP10BO94823 1461 aa23.59■■□□□ 1.37
TTLL3-229ENST00000492440 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.57■■□□□ 1.36
TTLL3-229ENST00000492440 UACAQ9BZF9 1416 aa23.55■■□□□ 1.36
TTLL3-229ENST00000492440 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.54■■□□□ 1.36
TTLL3-229ENST00000492440 NAIPQ13075 1403 aa23.53■■□□□ 1.36
TTLL3-229ENST00000492440 MAPKBP1O60336 1514 aa23.52■■□□□ 1.36
TTLL3-229ENST00000492440 KIF14Q15058 1648 aa23.5■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.5■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.48■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 ABCC2Q92887 1545 aa23.48■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.47■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.47■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 ROCK1Q13464 1354 aa23.46■■□□□ 1.35
TTLL3-229ENST00000492440 DAPK1P53355 1430 aa23.45■■□□□ 1.34
TTLL3-229ENST00000492440 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.44■■□□□ 1.34
TTLL3-229ENST00000492440 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TTLL3-229ENST00000492440 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms