RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.511e-10■■■■□ 20.9
NELFE-211ENST00000492185 GRIN2BQ13224 1484 aa30.72■■■□□ 2.51
NELFE-211ENST00000492185 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
NELFE-211ENST00000492185 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.71■■■□□ 2.51
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K1Q13233 1512 aa30.69■■■□□ 2.5
NELFE-211ENST00000492185 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
NELFE-211ENST00000492185 SAMD9Q5K651 1589 aa30.64■■■□□ 2.5
NELFE-211ENST00000492185 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
NELFE-211ENST00000492185 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
NELFE-211ENST00000492185 TIAM1Q13009 1591 aa30.57■■■□□ 2.49
NELFE-211ENST00000492185 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
NELFE-211ENST00000492185 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
NELFE-211ENST00000492185 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.54■■■□□ 2.48
NELFE-211ENST00000492185 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.53■■■□□ 2.48
NELFE-211ENST00000492185 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.51■■■□□ 2.47
NELFE-211ENST00000492185 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.48■■■□□ 2.47
NELFE-211ENST00000492185 IQGAP2Q13576 1575 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-211ENST00000492185 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-211ENST00000492185 FMN1Q68DA7 1419 aa30.45■■■□□ 2.47
NELFE-211ENST00000492185 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
NELFE-211ENST00000492185 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
NELFE-211ENST00000492185 P3H3Q8IVL6 736 aa30.41■■■□□ 2.46
NELFE-211ENST00000492185 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.4■■■□□ 2.46
NELFE-211ENST00000492185 GRIN2AQ12879 1464 aa30.37■■■□□ 2.45
NELFE-211ENST00000492185 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.36■■■□□ 2.45
NELFE-211ENST00000492185 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.32■■■□□ 2.44
NELFE-211ENST00000492185 SYNJ2O15056 1496 aa30.3■■■□□ 2.44
NELFE-211ENST00000492185 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
NELFE-211ENST00000492185 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.26■■■□□ 2.44
NELFE-211ENST00000492185 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
NELFE-211ENST00000492185 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.21■■■□□ 2.43
NELFE-211ENST00000492185 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
NELFE-211ENST00000492185 CEP170Q5SW79 1584 aa30.19■■■□□ 2.42
NELFE-211ENST00000492185 NUP160Q12769 1436 aa30.16■■■□□ 2.42
NELFE-211ENST00000492185 KIAA0556O60303 1618 aa30.16■■■□□ 2.42
NELFE-211ENST00000492185 DISP1Q96F81 1524 aa30.15■■■□□ 2.42
NELFE-211ENST00000492185 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.13■■■□□ 2.41
NELFE-211ENST00000492185 HECW1Q76N89 1606 aa30.12■■■□□ 2.41
NELFE-211ENST00000492185 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.1■■■□□ 2.41
NELFE-211ENST00000492185 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
NELFE-211ENST00000492185 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
NELFE-211ENST00000492185 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.04■■■□□ 2.4
NELFE-211ENST00000492185 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.392e-7■■■■□ 20.6
NELFE-211ENST00000492185 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
NELFE-211ENST00000492185 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.98■■■□□ 2.39
NELFE-211ENST00000492185 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
NELFE-211ENST00000492185 ARHGEF11O15085 1522 aa29.97■■■□□ 2.39
NELFE-211ENST00000492185 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.96■■■□□ 2.39
NELFE-211ENST00000492185 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.92■■■□□ 2.38
NELFE-211ENST00000492185 NCOA2Q15596 1464 aa29.92■■■□□ 2.38
NELFE-211ENST00000492185 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.9■■■□□ 2.38
NELFE-211ENST00000492185 FBLN2P98095 1184 aa29.88■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 CHD1O14646 1710 aa29.87■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.85■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.85■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 JPH4Q96JJ6 628 aa29.84■■■□□ 2.37
NELFE-211ENST00000492185 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
NELFE-211ENST00000492185 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.81■■■□□ 2.36
NELFE-211ENST00000492185 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 SHROOM2Q13796 1616 aa29.74■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.73■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 ABCA8O94911 1581 aa29.72■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.72■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.7■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 ITGAEP38570 1179 aa29.7■■■□□ 2.35
NELFE-211ENST00000492185 MIA2Q96PC5 1412 aa29.65■■■□□ 2.34
NELFE-211ENST00000492185 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
NELFE-211ENST00000492185 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.61■■■□□ 2.33
NELFE-211ENST00000492185 PTPRKQ15262 1439 aa29.6■■■□□ 2.33
NELFE-211ENST00000492185 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
NELFE-211ENST00000492185 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
NELFE-211ENST00000492185 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.55■■■□□ 2.32
NELFE-211ENST00000492185 HFM1A2PYH4 1435 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-211ENST00000492185 ARID3CA6NKF2 412 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-211ENST00000492185 MAPKBP1O60336 1514 aa29.52■■■□□ 2.32
NELFE-211ENST00000492185 PTPRGP23470 1445 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-211ENST00000492185 ATP10BO94823 1461 aa29.49■■■□□ 2.31
NELFE-211ENST00000492185 AKNAQ7Z591 1439 aa29.47■■■□□ 2.31
NELFE-211ENST00000492185 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.46■■■□□ 2.31
NELFE-211ENST00000492185 KIF14Q15058 1648 aa29.45■■■□□ 2.31
NELFE-211ENST00000492185 NAIPQ13075 1403 aa29.45■■■□□ 2.3
NELFE-211ENST00000492185 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.44■■■□□ 2.3
NELFE-211ENST00000492185 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.41■■■□□ 2.3
NELFE-211ENST00000492185 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
NELFE-211ENST00000492185 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
NELFE-211ENST00000492185 UACAQ9BZF9 1416 aa29.37■■■□□ 2.29
NELFE-211ENST00000492185 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.36■■■□□ 2.29
NELFE-211ENST00000492185 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.32■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 DAPK1P53355 1430 aa29.32■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 ABCC2Q92887 1545 aa29.31■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 ROCK1Q13464 1354 aa29.3■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.3■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 ABCC5O15440 1437 aa29.29■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.28■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
NELFE-211ENST00000492185 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.24■■■□□ 2.27
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