RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489427.1

WDR6-215, Transcript of WD repeat domain 6, humanhuman

TSL 4

Gene WDR6, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR6-215ENST00000489427 MAPKBP1O60336 1514 aa25.72■■□□□ 1.71
WDR6-215ENST00000489427 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
WDR6-215ENST00000489427 JPH4Q96JJ6 628 aa25.7■■□□□ 1.7
WDR6-215ENST00000489427 TSPOAP1O95153 1857 aa25.67■■□□□ 1.7
WDR6-215ENST00000489427 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.6■■□□□ 1.69
WDR6-215ENST00000489427 ADGRL1O94910 1474 aa25.6■■□□□ 1.69
WDR6-215ENST00000489427 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
WDR6-215ENST00000489427 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.56■■□□□ 1.68
WDR6-215ENST00000489427 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.51■■□□□ 1.67
WDR6-215ENST00000489427 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.47■■□□□ 1.67
WDR6-215ENST00000489427 FBXO41Q8TF61 875 aa25.37■■□□□ 1.65
WDR6-215ENST00000489427 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
WDR6-215ENST00000489427 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
WDR6-215ENST00000489427 TOP2BQ02880 1626 aa25.35■■□□□ 1.65
WDR6-215ENST00000489427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.34■■□□□ 1.65
WDR6-215ENST00000489427 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
WDR6-215ENST00000489427 ASXL2Q76L83 1435 aa25.26■■□□□ 1.63
WDR6-215ENST00000489427 PTPRGP23470 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
WDR6-215ENST00000489427 GLI2P10070 1586 aa25.25■■□□□ 1.63
WDR6-215ENST00000489427 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.24■■□□□ 1.63
WDR6-215ENST00000489427 ABCC2Q92887 1545 aa25.22■■□□□ 1.63
WDR6-215ENST00000489427 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.21■■□□□ 1.63
WDR6-215ENST00000489427 CUL7Q14999 1698 aa25.11■■□□□ 1.61
WDR6-215ENST00000489427 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
WDR6-215ENST00000489427 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.08■■□□□ 1.61
WDR6-215ENST00000489427 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.08■■□□□ 1.61
WDR6-215ENST00000489427 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.08■■□□□ 1.6
WDR6-215ENST00000489427 IGF1RP08069 1367 aa25.04■■□□□ 1.6
WDR6-215ENST00000489427 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.03■■□□□ 1.6
WDR6-215ENST00000489427 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
WDR6-215ENST00000489427 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.01■■□□□ 1.59
WDR6-215ENST00000489427 UACAQ9BZF9 1416 aa25■■□□□ 1.59
WDR6-215ENST00000489427 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
WDR6-215ENST00000489427 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
WDR6-215ENST00000489427 KIF21BO75037 1637 aa24.89■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 KIF27Q86VH2 1401 aa24.86■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 DISP1Q96F81 1524 aa24.85■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 IQGAP2Q13576 1575 aa24.84■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.83■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 ILDR2Q71H61 639 aa24.83■■□□□ 1.57
WDR6-215ENST00000489427 PTPRMP28827 1452 aa24.82■■□□□ 1.56
WDR6-215ENST00000489427 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.82■■□□□ 1.56
WDR6-215ENST00000489427 CD109Q6YHK3 1445 aa24.81■■□□□ 1.56
WDR6-215ENST00000489427 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.79■■□□□ 1.56
WDR6-215ENST00000489427 SOCS7O14512 581 aa24.76■■□□□ 1.55
WDR6-215ENST00000489427 KCNH8Q96L42 1107 aa24.76■■□□□ 1.55
WDR6-215ENST00000489427 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.73■■□□□ 1.55
WDR6-215ENST00000489427 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
WDR6-215ENST00000489427 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.7■■□□□ 1.55
WDR6-215ENST00000489427 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.7■■□□□ 1.54
WDR6-215ENST00000489427 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.65■■□□□ 1.54
WDR6-215ENST00000489427 CERKQ8TCT0 537 aa24.64■■□□□ 1.54
WDR6-215ENST00000489427 KIAA0556O60303 1618 aa24.64■■□□□ 1.53
WDR6-215ENST00000489427 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.63■■□□□ 1.53
WDR6-215ENST00000489427 HSPA2P54652 639 aa24.63■■□□□ 1.53
WDR6-215ENST00000489427 MADDQ8WXG6 1647 aa24.59■■□□□ 1.53
WDR6-215ENST00000489427 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.56■■□□□ 1.52
WDR6-215ENST00000489427 RAPGEF3O95398 923 aa24.56■■□□□ 1.52
WDR6-215ENST00000489427 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
WDR6-215ENST00000489427 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.5■■□□□ 1.51
WDR6-215ENST00000489427 ABCA8O94911 1581 aa24.49■■□□□ 1.51
WDR6-215ENST00000489427 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
WDR6-215ENST00000489427 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.45■■□□□ 1.51
WDR6-215ENST00000489427 ARID3CA6NKF2 412 aa24.45■■□□□ 1.5
WDR6-215ENST00000489427 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.42■■□□□ 1.5
WDR6-215ENST00000489427 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.39■■□□□ 1.5
WDR6-215ENST00000489427 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.37■■□□□ 1.49
WDR6-215ENST00000489427 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.35■■□□□ 1.49
WDR6-215ENST00000489427 NEO1Q92859 1461 aa24.33■■□□□ 1.49
WDR6-215ENST00000489427 ATP10BO94823 1461 aa24.32■■□□□ 1.48
WDR6-215ENST00000489427 GOLGA3Q08378 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
WDR6-215ENST00000489427 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.3■■□□□ 1.48
WDR6-215ENST00000489427 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.25■■□□□ 1.47
WDR6-215ENST00000489427 MLECQ14165 292 aa24.23■■□□□ 1.47
WDR6-215ENST00000489427 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.21■■□□□ 1.47
WDR6-215ENST00000489427 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.21■■□□□ 1.47
WDR6-215ENST00000489427 P3H3Q8IVL6 736 aa24.2■■□□□ 1.46
WDR6-215ENST00000489427 FANCAO15360 1455 aa24.19■■□□□ 1.46
WDR6-215ENST00000489427 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
WDR6-215ENST00000489427 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.18■■□□□ 1.46
WDR6-215ENST00000489427 AKNAQ7Z591 1439 aa24.17■■□□□ 1.46
WDR6-215ENST00000489427 RICTORQ6R327 1708 aa24.16■■□□□ 1.46
WDR6-215ENST00000489427 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.14■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.13■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 STRCQ7RTU9 1775 aa24.13■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.12■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.12■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.1■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.09■■□□□ 1.45
WDR6-215ENST00000489427 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.06■■□□□ 1.44
WDR6-215ENST00000489427 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.05■■□□□ 1.44
WDR6-215ENST00000489427 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.01■■□□□ 1.43
WDR6-215ENST00000489427 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.01■■□□□ 1.43
WDR6-215ENST00000489427 HECW1Q76N89 1606 aa23.99■■□□□ 1.43
WDR6-215ENST00000489427 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms