RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 JPH4Q96JJ6 628 aa28.61■■■□□ 2.17
SRPRB-204ENST00000484684 KDM6BO15054 1643 aa28.59■■■□□ 2.17
SRPRB-204ENST00000484684 MAPKBP1O60336 1514 aa28.58■■■□□ 2.17
SRPRB-204ENST00000484684 DIP2BQ9P265 1576 aa28.58■■■□□ 2.17
SRPRB-204ENST00000484684 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.57■■■□□ 2.16
SRPRB-204ENST00000484684 TOP2BQ02880 1626 aa28.47■■■□□ 2.15
SRPRB-204ENST00000484684 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.47■■■□□ 2.15
SRPRB-204ENST00000484684 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.46■■■□□ 2.15
SRPRB-204ENST00000484684 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.44■■■□□ 2.14
SRPRB-204ENST00000484684 TSPOAP1O95153 1857 aa28.44■■■□□ 2.14
SRPRB-204ENST00000484684 ADGRL1O94910 1474 aa28.25■■■□□ 2.11
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.22■■■□□ 2.11
SRPRB-204ENST00000484684 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SRPRB-204ENST00000484684 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SRPRB-204ENST00000484684 PTPRGP23470 1445 aa28.16■■■□□ 2.1
SRPRB-204ENST00000484684 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.13■■■□□ 2.09
SRPRB-204ENST00000484684 ABCC2Q92887 1545 aa28.1■■■□□ 2.09
SRPRB-204ENST00000484684 ASXL2Q76L83 1435 aa28.09■■■□□ 2.09
SRPRB-204ENST00000484684 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SRPRB-204ENST00000484684 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.08■■■□□ 2.09
SRPRB-204ENST00000484684 GLI2P10070 1586 aa28.07■■■□□ 2.08
SRPRB-204ENST00000484684 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.02■■■□□ 2.08
SRPRB-204ENST00000484684 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.01■■■□□ 2.08
SRPRB-204ENST00000484684 CUL7Q14999 1698 aa28■■■□□ 2.07
SRPRB-204ENST00000484684 IGF1RP08069 1367 aa28■■■□□ 2.07
SRPRB-204ENST00000484684 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SRPRB-204ENST00000484684 KIF27Q86VH2 1401 aa27.94■■■□□ 2.06
SRPRB-204ENST00000484684 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.94■■■□□ 2.06
SRPRB-204ENST00000484684 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.92■■■□□ 2.06
SRPRB-204ENST00000484684 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SRPRB-204ENST00000484684 UACAQ9BZF9 1416 aa27.9■■■□□ 2.06
SRPRB-204ENST00000484684 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.89■■■□□ 2.06
SRPRB-204ENST00000484684 IQGAP2Q13576 1575 aa27.83■■■□□ 2.05
SRPRB-204ENST00000484684 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.83■■■□□ 2.05
SRPRB-204ENST00000484684 FBXO41Q8TF61 875 aa27.82■■■□□ 2.04
SRPRB-204ENST00000484684 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.81■■■□□ 2.04
SRPRB-204ENST00000484684 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SRPRB-204ENST00000484684 DISP1Q96F81 1524 aa27.74■■■□□ 2.03
SRPRB-204ENST00000484684 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.69■■■□□ 2.02
SRPRB-204ENST00000484684 CD109Q6YHK3 1445 aa27.62■■■□□ 2.01
SRPRB-204ENST00000484684 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.6■■■□□ 2.01
SRPRB-204ENST00000484684 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.6■■■□□ 2.01
SRPRB-204ENST00000484684 KIF21BO75037 1637 aa27.59■■■□□ 2.01
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA0556O60303 1618 aa27.59■■■□□ 2.01
SRPRB-204ENST00000484684 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.56■■■□□ 2
SRPRB-204ENST00000484684 KCNH8Q96L42 1107 aa27.56■■■□□ 2
SRPRB-204ENST00000484684 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
SRPRB-204ENST00000484684 PTPRMP28827 1452 aa27.46■■□□□ 1.99
SRPRB-204ENST00000484684 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.41■■□□□ 1.98
SRPRB-204ENST00000484684 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.38■■□□□ 1.97
SRPRB-204ENST00000484684 ABCA8O94911 1581 aa27.36■■□□□ 1.97
SRPRB-204ENST00000484684 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.36■■□□□ 1.97
SRPRB-204ENST00000484684 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SRPRB-204ENST00000484684 GOLGA3Q08378 1498 aa27.34■■□□□ 1.97
SRPRB-204ENST00000484684 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SRPRB-204ENST00000484684 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.27■■□□□ 1.96
SRPRB-204ENST00000484684 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.27■■□□□ 1.96
SRPRB-204ENST00000484684 ARID3CA6NKF2 412 aa27.26■■□□□ 1.95
SRPRB-204ENST00000484684 RAPGEF3O95398 923 aa27.26■■□□□ 1.95
SRPRB-204ENST00000484684 MADDQ8WXG6 1647 aa27.26■■□□□ 1.95
SRPRB-204ENST00000484684 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.25■■□□□ 1.95
SRPRB-204ENST00000484684 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SRPRB-204ENST00000484684 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.19■■□□□ 1.94
SRPRB-204ENST00000484684 HSPA2P54652 639 aa27.16■■□□□ 1.94
SRPRB-204ENST00000484684 NEO1Q92859 1461 aa27.16■■□□□ 1.94
SRPRB-204ENST00000484684 ATP10BO94823 1461 aa27.15■■□□□ 1.94
SRPRB-204ENST00000484684 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SRPRB-204ENST00000484684 CERKQ8TCT0 537 aa27.14■■□□□ 1.94
SRPRB-204ENST00000484684 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.13■■□□□ 1.93
SRPRB-204ENST00000484684 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.11■■□□□ 1.93
SRPRB-204ENST00000484684 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.08■■□□□ 1.93
SRPRB-204ENST00000484684 P3H3Q8IVL6 736 aa27.07■■□□□ 1.92
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.06■■□□□ 1.92
SRPRB-204ENST00000484684 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SRPRB-204ENST00000484684 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SRPRB-204ENST00000484684 SOCS7O14512 581 aa27.03■■□□□ 1.92
SRPRB-204ENST00000484684 ILDR2Q71H61 639 aa27.03■■□□□ 1.92
SRPRB-204ENST00000484684 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.01■■□□□ 1.91
SRPRB-204ENST00000484684 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SRPRB-204ENST00000484684 FANCAO15360 1455 aa26.98■■□□□ 1.91
SRPRB-204ENST00000484684 AKNAQ7Z591 1439 aa26.95■■□□□ 1.9
SRPRB-204ENST00000484684 PRXQ9BXM0 1461 aa26.94■■□□□ 1.9
SRPRB-204ENST00000484684 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.94■■□□□ 1.9
SRPRB-204ENST00000484684 RICTORQ6R327 1708 aa26.93■■□□□ 1.9
SRPRB-204ENST00000484684 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.9■■□□□ 1.9
SRPRB-204ENST00000484684 MLECQ14165 292 aa26.9■■□□□ 1.9
SRPRB-204ENST00000484684 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.87■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.86■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.86■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.84■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.84■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.84■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.83■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 SAMD9Q5K651 1589 aa26.83■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.83■■□□□ 1.89
SRPRB-204ENST00000484684 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.82■■□□□ 1.88
SRPRB-204ENST00000484684 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.8■■□□□ 1.88
SRPRB-204ENST00000484684 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.79■■□□□ 1.88
SRPRB-204ENST00000484684 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms