RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472645.1

TIMM17B-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17B, Length 804 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-206ENST00000472645 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.5■■■□□ 2.15
TIMM17B-206ENST00000472645 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.47■■■□□ 2.15
TIMM17B-206ENST00000472645 MAPKBP1O60336 1514 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM17B-206ENST00000472645 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.35■■■□□ 2.13
TIMM17B-206ENST00000472645 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM17B-206ENST00000472645 IGF1RP08069 1367 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM17B-206ENST00000472645 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM17B-206ENST00000472645 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.29■■■□□ 2.12
TIMM17B-206ENST00000472645 DIP2BQ9P265 1576 aa28.28■■■□□ 2.12
TIMM17B-206ENST00000472645 PTPRGP23470 1445 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM17B-206ENST00000472645 KIF27Q86VH2 1401 aa28.16■■■□□ 2.1
TIMM17B-206ENST00000472645 KDM6BO15054 1643 aa28.14■■■□□ 2.09
TIMM17B-206ENST00000472645 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TIMM17B-206ENST00000472645 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM17B-206ENST00000472645 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.05■■■□□ 2.08
TIMM17B-206ENST00000472645 TSPOAP1O95153 1857 aa28.04■■■□□ 2.08
TIMM17B-206ENST00000472645 CUL7Q14999 1698 aa28.02■■■□□ 2.08
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCC2Q92887 1545 aa28.02■■■□□ 2.08
TIMM17B-206ENST00000472645 ASXL2Q76L83 1435 aa28.01■■■□□ 2.07
TIMM17B-206ENST00000472645 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28■■■□□ 2.07
TIMM17B-206ENST00000472645 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.96■■■□□ 2.07
TIMM17B-206ENST00000472645 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TIMM17B-206ENST00000472645 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM17B-206ENST00000472645 GLI2P10070 1586 aa27.92■■■□□ 2.06
TIMM17B-206ENST00000472645 UACAQ9BZF9 1416 aa27.91■■■□□ 2.06
TIMM17B-206ENST00000472645 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TIMM17B-206ENST00000472645 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TIMM17B-206ENST00000472645 DISP1Q96F81 1524 aa27.86■■■□□ 2.05
TIMM17B-206ENST00000472645 IQGAP2Q13576 1575 aa27.84■■■□□ 2.05
TIMM17B-206ENST00000472645 ADGRL1O94910 1474 aa27.83■■■□□ 2.04
TIMM17B-206ENST00000472645 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TIMM17B-206ENST00000472645 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.81■■■□□ 2.04
TIMM17B-206ENST00000472645 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM17B-206ENST00000472645 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.7■■■□□ 2.02
TIMM17B-206ENST00000472645 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.7■■■□□ 2.02
TIMM17B-206ENST00000472645 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.69■■■□□ 2.02
TIMM17B-206ENST00000472645 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
TIMM17B-206ENST00000472645 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.6■■■□□ 2.01
TIMM17B-206ENST00000472645 KIAA0556O60303 1618 aa27.59■■■□□ 2.01
TIMM17B-206ENST00000472645 KCNH8Q96L42 1107 aa27.59■■■□□ 2.01
TIMM17B-206ENST00000472645 CD109Q6YHK3 1445 aa27.55■■■□□ 2
TIMM17B-206ENST00000472645 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.55■■■□□ 2
TIMM17B-206ENST00000472645 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.51■■■□□ 2
TIMM17B-206ENST00000472645 GOLGA3Q08378 1498 aa27.43■■□□□ 1.98
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCA8O94911 1581 aa27.43■■□□□ 1.98
TIMM17B-206ENST00000472645 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.36■■□□□ 1.97
TIMM17B-206ENST00000472645 ARID3CA6NKF2 412 aa27.34■■□□□ 1.97
TIMM17B-206ENST00000472645 PRXQ9BXM0 1461 aa27.32■■□□□ 1.96
TIMM17B-206ENST00000472645 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.32■■□□□ 1.96
TIMM17B-206ENST00000472645 P3H3Q8IVL6 736 aa27.31■■□□□ 1.96
TIMM17B-206ENST00000472645 ATP10BO94823 1461 aa27.3■■□□□ 1.96
TIMM17B-206ENST00000472645 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.27■■□□□ 1.96
TIMM17B-206ENST00000472645 RAPGEF3O95398 923 aa27.26■■□□□ 1.95
TIMM17B-206ENST00000472645 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TIMM17B-206ENST00000472645 KIF21BO75037 1637 aa27.23■■□□□ 1.95
TIMM17B-206ENST00000472645 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.23■■□□□ 1.95
TIMM17B-206ENST00000472645 FBXO41Q8TF61 875 aa27.23■■□□□ 1.95
TIMM17B-206ENST00000472645 PTPRMP28827 1452 aa27.18■■□□□ 1.94
TIMM17B-206ENST00000472645 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.12■■□□□ 1.93
TIMM17B-206ENST00000472645 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.11■■□□□ 1.93
TIMM17B-206ENST00000472645 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TIMM17B-206ENST00000472645 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TIMM17B-206ENST00000472645 NEO1Q92859 1461 aa27.1■■□□□ 1.93
TIMM17B-206ENST00000472645 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TIMM17B-206ENST00000472645 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.07■■□□□ 1.92
TIMM17B-206ENST00000472645 SAMD9Q5K651 1589 aa27■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.98■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.98■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.97■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.96■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.96■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TIMM17B-206ENST00000472645 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TIMM17B-206ENST00000472645 MADDQ8WXG6 1647 aa26.93■■□□□ 1.9
TIMM17B-206ENST00000472645 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TIMM17B-206ENST00000472645 AKNAQ7Z591 1439 aa26.92■■□□□ 1.9
TIMM17B-206ENST00000472645 HSPA2P54652 639 aa26.91■■□□□ 1.9
TIMM17B-206ENST00000472645 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.9■■□□□ 1.9
TIMM17B-206ENST00000472645 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.85■■□□□ 1.89
TIMM17B-206ENST00000472645 FANCAO15360 1455 aa26.84■■□□□ 1.89
TIMM17B-206ENST00000472645 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.83■■□□□ 1.89
TIMM17B-206ENST00000472645 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.81■■□□□ 1.88
TIMM17B-206ENST00000472645 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
TIMM17B-206ENST00000472645 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.79■■□□□ 1.88
TIMM17B-206ENST00000472645 RICTORQ6R327 1708 aa26.79■■□□□ 1.88
TIMM17B-206ENST00000472645 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TIMM17B-206ENST00000472645 MLECQ14165 292 aa26.77■■□□□ 1.88
TIMM17B-206ENST00000472645 CERKQ8TCT0 537 aa26.75■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.74■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.73■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 EEA1Q15075 1411 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.71■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.7■■□□□ 1.87
TIMM17B-206ENST00000472645 PLCH2O75038 1416 aa26.7■■□□□ 1.86
TIMM17B-206ENST00000472645 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
TIMM17B-206ENST00000472645 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms