RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 CDCA8Q53HL2 280 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.32■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.31■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 KIF27Q86VH2 1401 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 BECN1Q14457 450 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.28■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 CFAP53Q96M91 514 aa17.27■□□□□ 0.36
TNS1-207ENST00000430930 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TNS1-207ENST00000430930 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.25■□□□□ 0.35
TNS1-207ENST00000430930 MIER1Q8N108 512 aa17.24■□□□□ 0.35
TNS1-207ENST00000430930 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.24■□□□□ 0.35
TNS1-207ENST00000430930 NBR1Q14596 966 aa17.21■□□□□ 0.35
TNS1-207ENST00000430930 NCLP19338 710 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
TNS1-207ENST00000430930 KCNH8Q96L42 1107 aa17.19■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.18■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.17■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 C14orf37Q86TY3 774 aa17.17■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 CASC1Q6TDU7 716 aa17.16■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.15■□□□□ 0.34
TNS1-207ENST00000430930 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.12■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.11■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 RGL3Q3MIN7 710 aa17.1■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 A0A0G2JS52 829 aa17.1■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 NUDCQ9Y266 331 aa17.09■□□□□ 0.33
TNS1-207ENST00000430930 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.08■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.07■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 ARXQ96QS3 562 aa17.07■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 MS4A1P11836 297 aa17.05■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.03■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 ERCC6Q03468 1493 aa17.03■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TNS1-207ENST00000430930 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
TNS1-207ENST00000430930 KANK1Q14678 1352 aa17.01■□□□□ 0.31
TNS1-207ENST00000430930 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17■□□□□ 0.31
TNS1-207ENST00000430930 POGKQ9P215 609 aa16.99■□□□□ 0.31
TNS1-207ENST00000430930 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.98■□□□□ 0.31
TNS1-207ENST00000430930 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TNS1-207ENST00000430930 TMF1P82094 1093 aa16.95■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 PLEKHG5O94827 1062 aa16.95■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.91■□□□□ 0.3
TNS1-207ENST00000430930 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.89■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 CUX2O14529 1486 aa16.89■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 CFAP44Q96MT7 982 aa16.88■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 NEUROD2Q15784 382 aa16.88■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.87■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.86■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.85■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 CCER2I3L3R5 266 aa16.85■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.84■□□□□ 0.29
TNS1-207ENST00000430930 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.82■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.8■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 RGS3P49796 1198 aa16.8■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 SMARCA2P51531 1590 aa16.79■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 NPHP1O15259 732 aa16.78■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 MCCP23508 829 aa16.78■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 MORC1Q86VD1 984 aa16.77■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 HSCBQ8IWL3 235 aa16.77■□□□□ 0.28
TNS1-207ENST00000430930 NRDCO43847 1150 aa16.77■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 FGD1P98174 961 aa16.77■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 KCNJ4P48050 445 aa16.75■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 FMN1Q68DA7 1419 aa16.75■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 SOGA1O94964 1423 aa16.74■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA2Q08379 1002 aa16.74■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.73■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TNS1-207ENST00000430930 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms