RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.7■■■■□ 3.15
LTB-210ENST00000429299 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.68■■■■□ 3.14
LTB-210ENST00000429299 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.63■■■■□ 3.13
LTB-210ENST00000429299 MAPKBP1O60336 1514 aa34.55■■■■□ 3.12
LTB-210ENST00000429299 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.54■■■■□ 3.12
LTB-210ENST00000429299 DIP2BQ9P265 1576 aa34.44■■■■□ 3.1
LTB-210ENST00000429299 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.43■■■■□ 3.1
LTB-210ENST00000429299 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.43■■■■□ 3.1
LTB-210ENST00000429299 IGF1RP08069 1367 aa34.38■■■■□ 3.09
LTB-210ENST00000429299 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.33■■■■□ 3.09
LTB-210ENST00000429299 KDM6BO15054 1643 aa34.3■■■■□ 3.08
LTB-210ENST00000429299 KIF27Q86VH2 1401 aa34.29■■■■□ 3.08
LTB-210ENST00000429299 PTPRGP23470 1445 aa34.26■■■■□ 3.07
LTB-210ENST00000429299 CUL7Q14999 1698 aa34.22■■■■□ 3.07
LTB-210ENST00000429299 TSPOAP1O95153 1857 aa34.2■■■■□ 3.07
LTB-210ENST00000429299 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.13■■■■□ 3.05
LTB-210ENST00000429299 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.13■■■■□ 3.05
LTB-210ENST00000429299 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.12■■■■□ 3.05
LTB-210ENST00000429299 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
LTB-210ENST00000429299 ABCC2Q92887 1545 aa34.09■■■■□ 3.05
LTB-210ENST00000429299 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.07■■■■□ 3.04
LTB-210ENST00000429299 ASXL2Q76L83 1435 aa34.04■■■■□ 3.04
LTB-210ENST00000429299 GLI2P10070 1586 aa34■■■■□ 3.03
LTB-210ENST00000429299 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.99■■■■□ 3.03
LTB-210ENST00000429299 UACAQ9BZF9 1416 aa33.95■■■■□ 3.02
LTB-210ENST00000429299 IQGAP2Q13576 1575 aa33.94■■■■□ 3.02
LTB-210ENST00000429299 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
LTB-210ENST00000429299 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
LTB-210ENST00000429299 DISP1Q96F81 1524 aa33.85■■■■□ 3.01
LTB-210ENST00000429299 ADGRL1O94910 1474 aa33.83■■■■□ 3.01
LTB-210ENST00000429299 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.83■■■■□ 3.01
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LTB-210ENST00000429299 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
LTB-210ENST00000429299 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.77■■■■□ 3
LTB-210ENST00000429299 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.74■■■□□ 2.99
LTB-210ENST00000429299 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.74■■■□□ 2.99
LTB-210ENST00000429299 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.71■■■□□ 2.99
LTB-210ENST00000429299 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
LTB-210ENST00000429299 KIAA0556O60303 1618 aa33.61■■■□□ 2.97
LTB-210ENST00000429299 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.6■■■□□ 2.97
LTB-210ENST00000429299 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.52■■■□□ 2.96
LTB-210ENST00000429299 CD109Q6YHK3 1445 aa33.51■■■□□ 2.95
LTB-210ENST00000429299 KCNH8Q96L42 1107 aa33.5■■■□□ 2.95
LTB-210ENST00000429299 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.48■■■□□ 2.95
LTB-210ENST00000429299 GOLGA3Q08378 1498 aa33.46■■■□□ 2.95
LTB-210ENST00000429299 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.4■■■□□ 2.94
LTB-210ENST00000429299 ABCA8O94911 1581 aa33.38■■■□□ 2.93
LTB-210ENST00000429299 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.34■■■□□ 2.93
LTB-210ENST00000429299 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
LTB-210ENST00000429299 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.26■■■□□ 2.91
LTB-210ENST00000429299 PRXQ9BXM0 1461 aa33.22■■■□□ 2.91
LTB-210ENST00000429299 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.21■■■□□ 2.91
LTB-210ENST00000429299 KIF21BO75037 1637 aa33.17■■■□□ 2.9
LTB-210ENST00000429299 ATP10BO94823 1461 aa33.17■■■□□ 2.9
LTB-210ENST00000429299 ARID3CA6NKF2 412 aa33.15■■■□□ 2.9
LTB-210ENST00000429299 P3H3Q8IVL6 736 aa33.12■■■□□ 2.89
LTB-210ENST00000429299 FBXO41Q8TF61 875 aa33.11■■■□□ 2.89
LTB-210ENST00000429299 RAPGEF3O95398 923 aa33.07■■■□□ 2.88
LTB-210ENST00000429299 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.05■■■□□ 2.88
LTB-210ENST00000429299 PTPRMP28827 1452 aa33.05■■■□□ 2.88
LTB-210ENST00000429299 NEO1Q92859 1461 aa33.01■■■□□ 2.88
LTB-210ENST00000429299 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.01■■■□□ 2.87
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LTB-210ENST00000429299 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.9■■■□□ 2.86
LTB-210ENST00000429299 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.88■■■□□ 2.85
LTB-210ENST00000429299 SAMD9Q5K651 1589 aa32.88■■■□□ 2.85
LTB-210ENST00000429299 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.85■■■□□ 2.85
LTB-210ENST00000429299 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.82■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.82■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 MADDQ8WXG6 1647 aa32.79■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.78■■■□□ 2.84
LTB-210ENST00000429299 AKNAQ7Z591 1439 aa32.74■■■□□ 2.83
LTB-210ENST00000429299 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.72■■■□□ 2.83
LTB-210ENST00000429299 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
LTB-210ENST00000429299 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.7■■■□□ 2.83
LTB-210ENST00000429299 FANCAO15360 1455 aa32.68■■■□□ 2.82
LTB-210ENST00000429299 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.68■■■□□ 2.82
LTB-210ENST00000429299 RICTORQ6R327 1708 aa32.66■■■□□ 2.82
LTB-210ENST00000429299 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
LTB-210ENST00000429299 HSPA2P54652 639 aa32.63■■■□□ 2.81
LTB-210ENST00000429299 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.62■■■□□ 2.81
LTB-210ENST00000429299 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.81
LTB-210ENST00000429299 EEA1Q15075 1411 aa32.6■■■□□ 2.81
LTB-210ENST00000429299 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.59■■■□□ 2.81
LTB-210ENST00000429299 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.58■■■□□ 2.81
LTB-210ENST00000429299 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.57■■■□□ 2.8
LTB-210ENST00000429299 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.55■■■□□ 2.8
LTB-210ENST00000429299 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.54■■■□□ 2.8
LTB-210ENST00000429299 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.54■■■□□ 2.8
LTB-210ENST00000429299 MLECQ14165 292 aa32.51■■■□□ 2.79
LTB-210ENST00000429299 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.5■■■□□ 2.79
LTB-210ENST00000429299 CERKQ8TCT0 537 aa32.5■■■□□ 2.79
LTB-210ENST00000429299 PLCH2O75038 1416 aa32.47■■■□□ 2.79
LTB-210ENST00000429299 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.47■■■□□ 2.79
LTB-210ENST00000429299 HECW1Q76N89 1606 aa32.44■■■□□ 2.78
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