RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
USP25-204ENST00000400183 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.48■■□□□ 1.51
USP25-204ENST00000400183 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
USP25-204ENST00000400183 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.45■■□□□ 1.5
USP25-204ENST00000400183 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
USP25-204ENST00000400183 ARXQ96QS3 562 aa24.45■■□□□ 1.5
USP25-204ENST00000400183 KCNH8Q96L42 1107 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-204ENST00000400183 EEA1Q15075 1411 aa24.39■■□□□ 1.5
USP25-204ENST00000400183 A0A0G2JS52 829 aa24.38■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 C14orf37Q86TY3 774 aa24.37■■□□□ 1.49
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USP25-204ENST00000400183 BECN1Q14457 450 aa24.36■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 CFAP53Q96M91 514 aa24.35■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.35■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 CDCA8Q53HL2 280 aa24.35■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.35■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 GOLGA3Q08378 1498 aa24.35■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.33■■□□□ 1.49
USP25-204ENST00000400183 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
USP25-204ENST00000400183 CEP162Q5TB80 1403 aa24.3■■□□□ 1.48
USP25-204ENST00000400183 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.29■■□□□ 1.48
USP25-204ENST00000400183 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
USP25-204ENST00000400183 PLEKHG5O94827 1062 aa24.27■■□□□ 1.48
USP25-204ENST00000400183 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
USP25-204ENST00000400183 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.24■■□□□ 1.47
USP25-204ENST00000400183 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.22■■□□□ 1.47
USP25-204ENST00000400183 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
USP25-204ENST00000400183 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
USP25-204ENST00000400183 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
USP25-204ENST00000400183 KIF27Q86VH2 1401 aa24.16■■□□□ 1.46
USP25-204ENST00000400183 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
USP25-204ENST00000400183 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.13■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 CASC1Q6TDU7 716 aa24.12■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.12■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 NUDCQ9Y266 331 aa24.11■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.11■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.1■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.1■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 NEUROD2Q15784 382 aa24.08■■□□□ 1.45
USP25-204ENST00000400183 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.07■■□□□ 1.44
USP25-204ENST00000400183 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
USP25-204ENST00000400183 POGKQ9P215 609 aa24.05■■□□□ 1.44
USP25-204ENST00000400183 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
USP25-204ENST00000400183 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
USP25-204ENST00000400183 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
USP25-204ENST00000400183 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.99■■□□□ 1.43
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USP25-204ENST00000400183 MS4A1P11836 297 aa23.95■■□□□ 1.42
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USP25-204ENST00000400183 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
USP25-204ENST00000400183 TMF1P82094 1093 aa23.89■■□□□ 1.41
USP25-204ENST00000400183 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.87■■□□□ 1.41
USP25-204ENST00000400183 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
USP25-204ENST00000400183 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.85■■□□□ 1.41
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USP25-204ENST00000400183 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.84■■□□□ 1.41
USP25-204ENST00000400183 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.83■■□□□ 1.41
USP25-204ENST00000400183 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.83■■□□□ 1.41
USP25-204ENST00000400183 KANK1Q14678 1352 aa23.81■■□□□ 1.4
USP25-204ENST00000400183 FGD1P98174 961 aa23.8■■□□□ 1.4
USP25-204ENST00000400183 NACADO15069 1562 aa23.8■■□□□ 1.4
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USP25-204ENST00000400183 ERCC6Q03468 1493 aa23.79■■□□□ 1.4
USP25-204ENST00000400183 KCNJ4P48050 445 aa23.77■■□□□ 1.4
USP25-204ENST00000400183 NPHP1O15259 732 aa23.77■■□□□ 1.4
USP25-204ENST00000400183 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
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USP25-204ENST00000400183 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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USP25-204ENST00000400183 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.74■■□□□ 1.39
USP25-204ENST00000400183 PLCB2Q00722 1185 aa23.73■■□□□ 1.39
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USP25-204ENST00000400183 CCER2I3L3R5 266 aa23.68■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.68■■□□□ 1.38
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USP25-204ENST00000400183 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 GOLGA2Q08379 1002 aa23.67■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 HSCBQ8IWL3 235 aa23.67■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 CUX2O14529 1486 aa23.66■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 NRDCO43847 1150 aa23.66■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.64■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 SOX12O15370 315 aa23.63■■□□□ 1.37
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