RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 TSPY4P0CV99 314 aa22.04■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 TSPY10P0CW01 314 aa22.04■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 KIF27Q86VH2 1401 aa22.03■■□□□ 1.12
SYT6-201ENST00000369547 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYT6-201ENST00000369547 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
SYT6-201ENST00000369547 RGL3Q3MIN7 710 aa21.96■■□□□ 1.11
SYT6-201ENST00000369547 KCNH8Q96L42 1107 aa21.94■■□□□ 1.1
SYT6-201ENST00000369547 SLC24A1O60721 1099 aa21.94■■□□□ 1.1
SYT6-201ENST00000369547 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SYT6-201ENST00000369547 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.92■■□□□ 1.1
SYT6-201ENST00000369547 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.86■■□□□ 1.09
SYT6-201ENST00000369547 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYT6-201ENST00000369547 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT6-201ENST00000369547 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYT6-201ENST00000369547 WIZO95785 1651 aa21.83■■□□□ 1.09
SYT6-201ENST00000369547 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.82■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.81■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 CUX2O14529 1486 aa21.81■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 NBR1Q14596 966 aa21.79■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.78■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 NEFMP07197 916 aa21.77■■□□□ 1.08
SYT6-201ENST00000369547 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.76■■□□□ 1.07
SYT6-201ENST00000369547 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.76■■□□□ 1.07
SYT6-201ENST00000369547 FOXD1Q16676 465 aa21.74■■□□□ 1.07
SYT6-201ENST00000369547 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SYT6-201ENST00000369547 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SYT6-201ENST00000369547 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.68■■□□□ 1.06
SYT6-201ENST00000369547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SYT6-201ENST00000369547 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SYT6-201ENST00000369547 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.6■■□□□ 1.05
SYT6-201ENST00000369547 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.59■■□□□ 1.05
SYT6-201ENST00000369547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.57■■□□□ 1.04
SYT6-201ENST00000369547 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.57■■□□□ 1.04
SYT6-201ENST00000369547 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-201ENST00000369547 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-201ENST00000369547 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-201ENST00000369547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-201ENST00000369547 NEUROD2Q15784 382 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 ARXQ96QS3 562 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 PLEKHG5O94827 1062 aa21.46■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SYT6-201ENST00000369547 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.45■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 PKD2Q13563 968 aa21.43■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.42■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.41■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.4■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.4■■□□□ 1.02
SYT6-201ENST00000369547 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.39■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.38■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 SMARCA2P51531 1590 aa21.37■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.36■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.35■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 ERCC6Q03468 1493 aa21.34■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 CCER2I3L3R5 266 aa21.33■■□□□ 1.01
SYT6-201ENST00000369547 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.31■■□□□ 1
SYT6-201ENST00000369547 RGS3P49796 1198 aa21.3■■□□□ 1
SYT6-201ENST00000369547 SMARCA4P51532 1647 aa21.29■■□□□ 1
SYT6-201ENST00000369547 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SYT6-201ENST00000369547 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 CDCA8Q53HL2 280 aa21.23■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 FMN1Q68DA7 1419 aa21.22■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 NUP155O75694 1391 aa21.22■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
SYT6-201ENST00000369547 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.2■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 TMF1P82094 1093 aa21.19■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.18■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 C14orf37Q86TY3 774 aa21.18■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 CFAP53Q96M91 514 aa21.16■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 GGT6Q6P531 493 aa21.16■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.14■□□□□ 0.98
SYT6-201ENST00000369547 IGF1RP08069 1367 aa21.13■□□□□ 0.97
SYT6-201ENST00000369547 POGKQ9P215 609 aa21.12■□□□□ 0.97
SYT6-201ENST00000369547 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYT6-201ENST00000369547 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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SYT6-201ENST00000369547 JPH4Q96JJ6 628 aa21.08■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 STK26Q9P289 416 aa21.06■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.05■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.05■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 SOX12O15370 315 aa21.04■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.03■□□□□ 0.96
SYT6-201ENST00000369547 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.02■□□□□ 0.96
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