RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C14orf37Q86TY3 774 aa10.93□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLHL34Q8N239 644 aa10.93□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCB7O75027 752 aa10.9□□□□□ -0.66
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.87□□□□□ -0.67
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.86□□□□□ -0.67
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMARCA4P51532 1647 aa10.78□□□□□ -0.68
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WIZO95785 1651 aa10.77□□□□□ -0.69
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DSG3P32926 999 aa10.73□□□□□ -0.69
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.73□□□□□ -0.69
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.67□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OSCARQ8IYS5 282 aa10.66□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMARCA2P51531 1590 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NESP48681 1621 aa10.59□□□□□ -0.71
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MIER1Q8N108 512 aa10.58□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCAPD3P42695 1498 aa10.57□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.56□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.56□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.53□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.53□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.53□□□□□ -0.72
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMGXB3Q12766 1538 aa10.5□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.47□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE6P0CI01 402 aa10.47□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.47□□□□□ -0.73
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.45□□□□□ -0.74
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM41Q8WV44 630 aa10.44□□□□□ -0.74
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HRCP23327 699 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEUROD2Q15784 382 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERCC6Q03468 1493 aa10.43□□□□□ -0.74
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STK25O00506 426 aa10.4□□□□□ -0.74
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.38□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 P3H3Q8IVL6 736 aa10.37□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.37□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.36□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.36□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCC8Q09428 1581 aa10.33□□□□□ -0.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFTRP13569 1480 aa10.31□□□□□ -0.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUBP1P53384 320 aa10.27□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.26□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.25□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STK24Q9Y6E0 443 aa10.25□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.25□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARID3AQ99856 593 aa10.25□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GSE1Q14687 1217 aa10.24□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.24□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHG5O94827 1062 aa10.23□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZMYND15Q9H091 742 aa10.21□□□□□ -0.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEMA3EO15041 775 aa10.2□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.19□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.18□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR70Q9NW82 654 aa10.18□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYNJ1O43426 1573 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUX2O14529 1486 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUX1P39880 1505 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZMYND10O75800 440 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOGA1O94964 1423 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRDM2Q13029 1718 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARID3CA6NKF2 412 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL27Q8NEV9 243 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR62O43379 1518 aa10.11□□□□□ -0.79
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