RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335171.10

ERLIN2-202, Transcript of ER lipid raft associated 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ERLIN2, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN2-202ENST00000335171 GRIN2BQ13224 1484 aa29.15■■■□□ 2.26
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ERLIN2-202ENST00000335171 MAP3K1Q13233 1512 aa29.09■■■□□ 2.25
ERLIN2-202ENST00000335171 ADAMTS12P58397 1594 aa29.07■■■□□ 2.24
ERLIN2-202ENST00000335171 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.248e-8■■■■□ 23
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ERLIN2-202ENST00000335171 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
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ERLIN2-202ENST00000335171 TIAM1Q13009 1591 aa28.93■■■□□ 2.22
ERLIN2-202ENST00000335171 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.9■■■□□ 2.22
ERLIN2-202ENST00000335171 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.89■■■□□ 2.22
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ERLIN2-202ENST00000335171 IQGAP2Q13576 1575 aa28.86■■■□□ 2.21
ERLIN2-202ENST00000335171 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.86■■■□□ 2.21
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ERLIN2-202ENST00000335171 GRIN2AQ12879 1464 aa28.76■■■□□ 2.2
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ERLIN2-202ENST00000335171 SYNJ2O15056 1496 aa28.73■■■□□ 2.19
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ERLIN2-202ENST00000335171 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.61■■■□□ 2.17
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ERLIN2-202ENST00000335171 CEP170Q5SW79 1584 aa28.51■■■□□ 2.15
ERLIN2-202ENST00000335171 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.49■■■□□ 2.15
ERLIN2-202ENST00000335171 DISP1Q96F81 1524 aa28.49■■■□□ 2.15
ERLIN2-202ENST00000335171 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.48■■■□□ 2.15
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ERLIN2-202ENST00000335171 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.43■■■□□ 2.14
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ERLIN2-202ENST00000335171 NCOA2Q15596 1464 aa28.34■■■□□ 2.13
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ERLIN2-202ENST00000335171 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.3■■■□□ 2.12
ERLIN2-202ENST00000335171 ARHGEF11O15085 1522 aa28.3■■■□□ 2.12
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ERLIN2-202ENST00000335171 CHD1O14646 1710 aa28.19■■■□□ 2.1
ERLIN2-202ENST00000335171 MIA2Q96PC5 1412 aa28.16■■■□□ 2.1
ERLIN2-202ENST00000335171 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.14■■■□□ 2.1
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ERLIN2-202ENST00000335171 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.13■■■□□ 2.09
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ERLIN2-202ENST00000335171 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.09■■■□□ 2.09
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ERLIN2-202ENST00000335171 DAPK1P53355 1430 aa27.78■■■□□ 2.04
ERLIN2-202ENST00000335171 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
ERLIN2-202ENST00000335171 ABCC2Q92887 1545 aa27.77■■■□□ 2.04
ERLIN2-202ENST00000335171 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.76■■■□□ 2.03
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ERLIN2-202ENST00000335171 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.74■■■□□ 2.03
ERLIN2-202ENST00000335171 ABCC5O15440 1437 aa27.72■■■□□ 2.03
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