RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313285.12

TRIP10-202, Transcript of thyroid hormone receptor interactor 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIP10, Length 2,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10-202ENST00000313285 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.71■■■■■ 5.07
TRIP10-202ENST00000313285 GRIN2BQ13224 1484 aa46.7■■■■■ 5.07
TRIP10-202ENST00000313285 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.69■■■■■ 5.06
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
TRIP10-202ENST00000313285 ADAMTS12P58397 1594 aa46.61■■■■■ 5.05
TRIP10-202ENST00000313285 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
TRIP10-202ENST00000313285 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
TRIP10-202ENST00000313285 MAP3K1Q13233 1512 aa46.54■■■■■ 5.04
TRIP10-202ENST00000313285 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.49■■■■■ 5.03
TRIP10-202ENST00000313285 P3H3Q8IVL6 736 aa46.47■■■■■ 5.03
TRIP10-202ENST00000313285 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
TRIP10-202ENST00000313285 SAMD9Q5K651 1589 aa46.43■■■■■ 5.02
TRIP10-202ENST00000313285 TIAM1Q13009 1591 aa46.4■■■■■ 5.02
TRIP10-202ENST00000313285 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
TRIP10-202ENST00000313285 FMN1Q68DA7 1419 aa46.34■■■■■ 5.01
TRIP10-202ENST00000313285 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.33■■■■■ 5.01
TRIP10-202ENST00000313285 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.31■■■■■ 5
TRIP10-202ENST00000313285 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.31■■■■■ 5
TRIP10-202ENST00000313285 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
TRIP10-202ENST00000313285 IQGAP2Q13576 1575 aa46.25■■■■■ 4.99
TRIP10-202ENST00000313285 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
TRIP10-202ENST00000313285 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.22■■■■■ 4.99
TRIP10-202ENST00000313285 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.22■■■■■ 4.99
TRIP10-202ENST00000313285 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
TRIP10-202ENST00000313285 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
TRIP10-202ENST00000313285 GRIN2AQ12879 1464 aa46.15■■■■■ 4.98
TRIP10-202ENST00000313285 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
TRIP10-202ENST00000313285 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.08■■■■■ 4.97
TRIP10-202ENST00000313285 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.06■■■■■ 4.96
TRIP10-202ENST00000313285 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
TRIP10-202ENST00000313285 SYNJ2O15056 1496 aa46.06■■■■■ 4.96
TRIP10-202ENST00000313285 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46■■■■■ 4.95
TRIP10-202ENST00000313285 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.95
TRIP10-202ENST00000313285 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.85■■■■■ 4.93
TRIP10-202ENST00000313285 CEP170Q5SW79 1584 aa45.82■■■■■ 4.93
TRIP10-202ENST00000313285 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.81■■■■■ 4.92
TRIP10-202ENST00000313285 DISP1Q96F81 1524 aa45.8■■■■■ 4.92
TRIP10-202ENST00000313285 NUP160Q12769 1436 aa45.79■■■■■ 4.92
TRIP10-202ENST00000313285 KIAA0556O60303 1618 aa45.78■■■■■ 4.92
TRIP10-202ENST00000313285 FBLN2P98095 1184 aa45.73■■■■■ 4.91
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.73■■■■■ 4.91
TRIP10-202ENST00000313285 HECW1Q76N89 1606 aa45.72■■■■■ 4.91
TRIP10-202ENST00000313285 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.71■■■■■ 4.91
TRIP10-202ENST00000313285 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.6■■■■■ 4.89
TRIP10-202ENST00000313285 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
TRIP10-202ENST00000313285 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.57■■■■■ 4.891e-7■■■□□ 16.9
TRIP10-202ENST00000313285 JPH4Q96JJ6 628 aa45.51■■■■■ 4.88
TRIP10-202ENST00000313285 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 NCOA2Q15596 1464 aa45.49■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.48■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.46■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.46■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 ITGAEP38570 1179 aa45.45■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
TRIP10-202ENST00000313285 ARHGEF11O15085 1522 aa45.43■■■■■ 4.86
TRIP10-202ENST00000313285 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
TRIP10-202ENST00000313285 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.41■■■■■ 4.86
TRIP10-202ENST00000313285 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.38■■■■■ 4.85
TRIP10-202ENST00000313285 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
TRIP10-202ENST00000313285 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
TRIP10-202ENST00000313285 CLSPNQ9HAW4 1339 aa45.34■■■■■ 4.85
TRIP10-202ENST00000313285 CHD1O14646 1710 aa45.28■■■■■ 4.84
TRIP10-202ENST00000313285 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.24■■■■■ 4.83
TRIP10-202ENST00000313285 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa45.24■■■■■ 4.83
TRIP10-202ENST00000313285 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
TRIP10-202ENST00000313285 ARID3CA6NKF2 412 aa45.18■■■■■ 4.82
TRIP10-202ENST00000313285 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
TRIP10-202ENST00000313285 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.12■■■■■ 4.81
TRIP10-202ENST00000313285 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
TRIP10-202ENST00000313285 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
TRIP10-202ENST00000313285 MIA2Q96PC5 1412 aa45.08■■■■■ 4.81
TRIP10-202ENST00000313285 ABCA8O94911 1581 aa45.07■■■■■ 4.81
TRIP10-202ENST00000313285 SHROOM2Q13796 1616 aa45.02■■■■■ 4.8
TRIP10-202ENST00000313285 PTPRKQ15262 1439 aa45■■■■■ 4.79
TRIP10-202ENST00000313285 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
TRIP10-202ENST00000313285 PTPRGP23470 1445 aa44.94■■■■■ 4.78
TRIP10-202ENST00000313285 HFM1A2PYH4 1435 aa44.92■■■■■ 4.78
TRIP10-202ENST00000313285 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.84■■■■■ 4.77
TRIP10-202ENST00000313285 ATP10BO94823 1461 aa44.84■■■■■ 4.77
TRIP10-202ENST00000313285 MAPKBP1O60336 1514 aa44.82■■■■■ 4.77
TRIP10-202ENST00000313285 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
TRIP10-202ENST00000313285 NAIPQ13075 1403 aa44.78■■■■■ 4.76
TRIP10-202ENST00000313285 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.74■■■■■ 4.75
TRIP10-202ENST00000313285 AKNAQ7Z591 1439 aa44.71■■■■■ 4.75
TRIP10-202ENST00000313285 KIF14Q15058 1648 aa44.7■■■■■ 4.75
TRIP10-202ENST00000313285 UACAQ9BZF9 1416 aa44.7■■■■■ 4.75
TRIP10-202ENST00000313285 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.67■■■■■ 4.74
TRIP10-202ENST00000313285 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
TRIP10-202ENST00000313285 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.67■■■■■ 4.74
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
TRIP10-202ENST00000313285 DAPK1P53355 1430 aa44.6■■■■■ 4.73
TRIP10-202ENST00000313285 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
TRIP10-202ENST00000313285 GCC2Q8IWJ2 1684 aa44.58■■■■■ 4.73
TRIP10-202ENST00000313285 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.56■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.56■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC5O15440 1437 aa44.54■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 ROCK1Q13464 1354 aa44.53■■■■■ 4.72
TRIP10-202ENST00000313285 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.51■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms