RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.65□□□□□ -0.06
HDGFL3-201ENST00000299633 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 ARID3CA6NKF2 412 aa14.63□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 P3H3Q8IVL6 736 aa14.6□□□□□ -0.07
HDGFL3-201ENST00000299633 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 ARID3AQ99856 593 aa14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.56□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 PLCB2Q00722 1185 aa14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 CASC1Q6TDU7 716 aa14.55□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 TONSLQ96HA7 1378 aa14.53□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 FBLN2P98095 1184 aa14.52□□□□□ -0.08
HDGFL3-201ENST00000299633 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 USP35Q9P2H5 1018 aa14.5□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 APPP05067 770 aa14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 DRC7Q8IY82 874 aa14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.44□□□□□ -0.1
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
HDGFL3-201ENST00000299633 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.43□□□□□ -0.1
HDGFL3-201ENST00000299633 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
HDGFL3-201ENST00000299633 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.4□□□□□ -0.1
HDGFL3-201ENST00000299633 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 CLSTN1O94985 981 aa14.35□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 TMC1Q8TDI8 760 aa14.34□□□□□ -0.11
HDGFL3-201ENST00000299633 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.33□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 MYO10Q9HD67 2058 aa14.33□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 MRS2Q9HD23 443 aa14.33□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.3□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.29□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 HSCBQ8IWL3 235 aa14.28□□□□□ -0.12
HDGFL3-201ENST00000299633 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.27□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.27□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 FGD1P98174 961 aa14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 CLIP1P30622 1438 aa14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.23□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.23□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.23□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.21□□□□□ -0.13
HDGFL3-201ENST00000299633 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.19□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 TPM4P67936 248 aa14.19□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.19□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 CEP162Q5TB80 1403 aa14.19□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 TEX35Q5T0J7 233 aa14.18□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 GBP4Q96PP9 640 aa14.18□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.17□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 RGS3P49796 1198 aa14.16□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 GPS2Q13227 327 aa14.15□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNJ4P48050 445 aa14.15□□□□□ -0.14
HDGFL3-201ENST00000299633 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.14□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.14□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.14□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLGA3Q08378 1498 aa14.14□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 MCCP23508 829 aa14.13□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP7D2Q96T17 732 aa14.12□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.11□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PDE4CQ08493 712 aa14.11□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 NEFHP12036 1026 aa14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0G2JS52 829 aa14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PHF14O94880 888 aa14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 MYH10P35580 1976 aa14.09□□□□□ -0.15
HDGFL3-201ENST00000299633 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms