RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.06■■■□□ 2.88
SNRNP25-201ENST00000293861 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.05■■■□□ 2.88
SNRNP25-201ENST00000293861 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS12P58397 1594 aa33.04■■■□□ 2.88
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
SNRNP25-201ENST00000293861 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K1Q13233 1512 aa32.9■■■□□ 2.86
SNRNP25-201ENST00000293861 SAMD9Q5K651 1589 aa32.85■■■□□ 2.85
SNRNP25-201ENST00000293861 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.82■■■□□ 2.84
SNRNP25-201ENST00000293861 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.81■■■□□ 2.84
SNRNP25-201ENST00000293861 TIAM1Q13009 1591 aa32.8■■■□□ 2.84
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
SNRNP25-201ENST00000293861 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 IQGAP2Q13576 1575 aa32.76■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.75■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 FMN1Q68DA7 1419 aa32.74■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 P3H3Q8IVL6 736 aa32.74■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.73■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.71■■■□□ 2.83
SNRNP25-201ENST00000293861 GRIN2AQ12879 1464 aa32.7■■■□□ 2.82
SNRNP25-201ENST00000293861 SYNJ2O15056 1496 aa32.66■■■□□ 2.82
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.63■■■□□ 2.81
SNRNP25-201ENST00000293861 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
SNRNP25-201ENST00000293861 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.62■■■□□ 2.81
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.61■■■□□ 2.81
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
SNRNP25-201ENST00000293861 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
SNRNP25-201ENST00000293861 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP170Q5SW79 1584 aa32.47■■■□□ 2.79
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.45■■■□□ 2.79
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP160Q12769 1436 aa32.45■■■□□ 2.79
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.78
SNRNP25-201ENST00000293861 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.43■■■□□ 2.78
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA0556O60303 1618 aa32.42■■■□□ 2.78
SNRNP25-201ENST00000293861 DISP1Q96F81 1524 aa32.39■■■□□ 2.78
SNRNP25-201ENST00000293861 HECW1Q76N89 1606 aa32.36■■■□□ 2.77
SNRNP25-201ENST00000293861 FBLN2P98095 1184 aa32.35■■■□□ 2.77
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.34■■■□□ 2.77
SNRNP25-201ENST00000293861 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.31■■■□□ 2.76
SNRNP25-201ENST00000293861 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.25■■■□□ 2.75
SNRNP25-201ENST00000293861 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.23■■■□□ 2.75
SNRNP25-201ENST00000293861 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
SNRNP25-201ENST00000293861 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.2■■■□□ 2.75
SNRNP25-201ENST00000293861 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
SNRNP25-201ENST00000293861 JPH4Q96JJ6 628 aa32.18■■■□□ 2.74
SNRNP25-201ENST00000293861 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.18■■■□□ 2.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CHD1O14646 1710 aa32.17■■■□□ 2.74
SNRNP25-201ENST00000293861 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.15■■■□□ 2.74
SNRNP25-201ENST00000293861 NCOA2Q15596 1464 aa32.1■■■□□ 2.73
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.1■■■□□ 2.73
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF11O15085 1522 aa32.09■■■□□ 2.73
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
SNRNP25-201ENST00000293861 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.07■■■□□ 2.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.04■■■□□ 2.72
SNRNP25-201ENST00000293861 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.02■■■□□ 2.72
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
SNRNP25-201ENST00000293861 SHROOM2Q13796 1616 aa31.97■■■□□ 2.71
SNRNP25-201ENST00000293861 ITGAEP38570 1179 aa31.96■■■□□ 2.71
SNRNP25-201ENST00000293861 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.95■■■□□ 2.71
SNRNP25-201ENST00000293861 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCA8O94911 1581 aa31.92■■■□□ 2.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.92■■■□□ 2.7
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.9■■■□□ 2.7
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.89■■■□□ 2.7
SNRNP25-201ENST00000293861 ARID3CA6NKF2 412 aa31.85■■■□□ 2.69
SNRNP25-201ENST00000293861 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
SNRNP25-201ENST00000293861 MIA2Q96PC5 1412 aa31.83■■■□□ 2.69
SNRNP25-201ENST00000293861 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.82■■■□□ 2.68
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRGP23470 1445 aa31.81■■■□□ 2.68
SNRNP25-201ENST00000293861 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
SNRNP25-201ENST00000293861 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.76■■■□□ 2.67
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRKQ15262 1439 aa31.72■■■□□ 2.67
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP10BO94823 1461 aa31.71■■■□□ 2.67
SNRNP25-201ENST00000293861 HFM1A2PYH4 1435 aa31.69■■■□□ 2.66
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPKBP1O60336 1514 aa31.66■■■□□ 2.66
SNRNP25-201ENST00000293861 UACAQ9BZF9 1416 aa31.65■■■□□ 2.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.64■■■□□ 2.66
SNRNP25-201ENST00000293861 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.64■■■□□ 2.66
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF14Q15058 1648 aa31.61■■■□□ 2.65
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.6■■■□□ 2.65
SNRNP25-201ENST00000293861 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.6■■■□□ 2.65
SNRNP25-201ENST00000293861 AKNAQ7Z591 1439 aa31.59■■■□□ 2.65
SNRNP25-201ENST00000293861 NAIPQ13075 1403 aa31.59■■■□□ 2.65
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC2Q92887 1545 aa31.56■■■□□ 2.64
SNRNP25-201ENST00000293861 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
SNRNP25-201ENST00000293861 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.51■■■□□ 2.63
SNRNP25-201ENST00000293861 DAPK1P53355 1430 aa31.47■■■□□ 2.63
SNRNP25-201ENST00000293861 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.47■■■□□ 2.63
SNRNP25-201ENST00000293861 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
SNRNP25-201ENST00000293861 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.45■■■□□ 2.63
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.45■■■□□ 2.62
SNRNP25-201ENST00000293861 ROCK1Q13464 1354 aa31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms