RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CCSAP-201ENST00000284617 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.04■■■□□ 2.08
CCSAP-201ENST00000284617 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.01■■■□□ 2.07
CCSAP-201ENST00000284617 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.01■■■□□ 2.07
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CCSAP-201ENST00000284617 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.96■■■□□ 2.07
CCSAP-201ENST00000284617 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.95■■■□□ 2.06
CCSAP-201ENST00000284617 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.92■■■□□ 2.06
CCSAP-201ENST00000284617 BECN1Q14457 450 aa27.89■■■□□ 2.06
CCSAP-201ENST00000284617 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.84■■■□□ 2.05
CCSAP-201ENST00000284617 ARXQ96QS3 562 aa27.84■■■□□ 2.05
CCSAP-201ENST00000284617 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.84■■■□□ 2.05
CCSAP-201ENST00000284617 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.82■■■□□ 2.04
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA8Q53HL2 280 aa27.82■■■□□ 2.04
CCSAP-201ENST00000284617 KIF27Q86VH2 1401 aa27.78■■■□□ 2.04
CCSAP-201ENST00000284617 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.76■■■□□ 2.04
CCSAP-201ENST00000284617 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.76■■■□□ 2.03
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP53Q96M91 514 aa27.74■■■□□ 2.03
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CCSAP-201ENST00000284617 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.72■■■□□ 2.03
CCSAP-201ENST00000284617 RGL3Q3MIN7 710 aa27.71■■■□□ 2.03
CCSAP-201ENST00000284617 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.69■■■□□ 2.02
CCSAP-201ENST00000284617 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.69■■■□□ 2.02
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.66■■■□□ 2.02
CCSAP-201ENST00000284617 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH8Q96L42 1107 aa27.63■■■□□ 2.01
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CCSAP-201ENST00000284617 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CCSAP-201ENST00000284617 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.57■■■□□ 2
CCSAP-201ENST00000284617 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.57■■■□□ 2
CCSAP-201ENST00000284617 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CCSAP-201ENST00000284617 NACADO15069 1562 aa27.53■■■□□ 2
CCSAP-201ENST00000284617 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.52■■■□□ 2
CCSAP-201ENST00000284617 CASC1Q6TDU7 716 aa27.49■■□□□ 1.99
CCSAP-201ENST00000284617 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.48■■□□□ 1.99
CCSAP-201ENST00000284617 NUDCQ9Y266 331 aa27.47■■□□□ 1.99
CCSAP-201ENST00000284617 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.46■■□□□ 1.99
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.46■■□□□ 1.99
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf37Q86TY3 774 aa27.43■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.42■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 CCER2I3L3R5 266 aa27.41■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A1P11836 297 aa27.4■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROD2Q15784 382 aa27.4■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.38■■□□□ 1.97
CCSAP-201ENST00000284617 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CCSAP-201ENST00000284617 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CCSAP-201ENST00000284617 RGS3P49796 1198 aa27.37■■□□□ 1.97
CCSAP-201ENST00000284617 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CCSAP-201ENST00000284617 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 TMF1P82094 1093 aa27.31■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.3■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 POGKQ9P215 609 aa27.27■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JS52 829 aa27.27■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.27■■□□□ 1.96
CCSAP-201ENST00000284617 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.26■■□□□ 1.95
CCSAP-201ENST00000284617 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.24■■□□□ 1.95
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.24■■□□□ 1.95
CCSAP-201ENST00000284617 SOGA1O94964 1423 aa27.23■■□□□ 1.95
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG5O94827 1062 aa27.22■■□□□ 1.95
CCSAP-201ENST00000284617 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 CUX2O14529 1486 aa27.16■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.15■■□□□ 1.94
CCSAP-201ENST00000284617 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.13■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 KANK1Q14678 1352 aa27.12■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 HSCBQ8IWL3 235 aa27.08■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP44Q96MT7 982 aa27.05■■□□□ 1.92
CCSAP-201ENST00000284617 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CCSAP-201ENST00000284617 MORC1Q86VD1 984 aa27.04■■□□□ 1.92
CCSAP-201ENST00000284617 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CCSAP-201ENST00000284617 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.03■■□□□ 1.92
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 PKD2Q13563 968 aa27.01■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 PLCB2Q00722 1185 aa26.99■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 FGD1P98174 961 aa26.99■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ4P48050 445 aa26.99■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 RALBP1Q15311 655 aa26.98■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.98■■□□□ 1.91
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms