RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.75■■□□□ 1.39
SCARB2-201ENST00000264896 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.75■■□□□ 1.39
SCARB2-201ENST00000264896 BCL11AQ9H165 835 aa23.69■■□□□ 1.38
SCARB2-201ENST00000264896 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
SCARB2-201ENST00000264896 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.65■■□□□ 1.38
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.64■■□□□ 1.38
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.64■■□□□ 1.38
SCARB2-201ENST00000264896 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.63■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 SLC24A1O60721 1099 aa23.63■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.59■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.59■■□□□ 1.37
SCARB2-201ENST00000264896 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.58■■□□□ 1.36
SCARB2-201ENST00000264896 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
SCARB2-201ENST00000264896 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SCARB2-201ENST00000264896 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.57■■□□□ 1.36
SCARB2-201ENST00000264896 ABCC8Q09428 1581 aa23.55■■□□□ 1.36
SCARB2-201ENST00000264896 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SCARB2-201ENST00000264896 CUX2O14529 1486 aa23.51■■□□□ 1.35
SCARB2-201ENST00000264896 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.51■■□□□ 1.35
SCARB2-201ENST00000264896 RGL3Q3MIN7 710 aa23.47■■□□□ 1.35
SCARB2-201ENST00000264896 KCNH8Q96L42 1107 aa23.45■■□□□ 1.35
SCARB2-201ENST00000264896 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SCARB2-201ENST00000264896 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SCARB2-201ENST00000264896 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.41■■□□□ 1.34
SCARB2-201ENST00000264896 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SCARB2-201ENST00000264896 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.37■■□□□ 1.33
SCARB2-201ENST00000264896 NBR1Q14596 966 aa23.37■■□□□ 1.33
SCARB2-201ENST00000264896 WIZO95785 1651 aa23.36■■□□□ 1.33
SCARB2-201ENST00000264896 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SCARB2-201ENST00000264896 SMARCA2P51531 1590 aa23.34■■□□□ 1.33
SCARB2-201ENST00000264896 CDCA8Q53HL2 280 aa23.32■■□□□ 1.32
SCARB2-201ENST00000264896 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.28■■□□□ 1.32
SCARB2-201ENST00000264896 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.28■■□□□ 1.32
SCARB2-201ENST00000264896 CCER2I3L3R5 266 aa23.27■■□□□ 1.32
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.25■■□□□ 1.31
SCARB2-201ENST00000264896 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.25■■□□□ 1.31
SCARB2-201ENST00000264896 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SCARB2-201ENST00000264896 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.23■■□□□ 1.31
SCARB2-201ENST00000264896 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SCARB2-201ENST00000264896 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.17■■□□□ 1.3
SCARB2-201ENST00000264896 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.16■■□□□ 1.3
SCARB2-201ENST00000264896 CFAP53Q96M91 514 aa23.15■■□□□ 1.3
SCARB2-201ENST00000264896 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
SCARB2-201ENST00000264896 FMN1Q68DA7 1419 aa23.14■■□□□ 1.3
SCARB2-201ENST00000264896 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.14■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.13■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.13■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 ERCC6Q03468 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.09■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SCARB2-201ENST00000264896 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.07■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.07■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.06■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 BECN1Q14457 450 aa23.05■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 PKD2Q13563 968 aa23.05■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.05■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.04■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 TMF1P82094 1093 aa23.04■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD1Q16676 465 aa23.04■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 SMARCA4P51532 1647 aa23.03■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.03■■□□□ 1.28
SCARB2-201ENST00000264896 NEUROD2Q15784 382 aa23■■□□□ 1.27
SCARB2-201ENST00000264896 ARXQ96QS3 562 aa22.97■■□□□ 1.27
SCARB2-201ENST00000264896 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.97■■□□□ 1.27
SCARB2-201ENST00000264896 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SCARB2-201ENST00000264896 NUDCQ9Y266 331 aa22.94■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.93■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.92■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 RGS3P49796 1198 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB2-201ENST00000264896 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 NUP155O75694 1391 aa22.89■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 POGKQ9P215 609 aa22.88■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 KANK1Q14678 1352 aa22.87■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.87■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SCARB2-201ENST00000264896 RALBP1Q15311 655 aa22.81■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 C14orf37Q86TY3 774 aa22.81■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 MS4A1P11836 297 aa22.8■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.77■■□□□ 1.24
SCARB2-201ENST00000264896 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.76■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.75■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 MORC1Q86VD1 984 aa22.74■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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