RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262462.8

SLC27A6-201, Transcript of solute carrier family 27 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC27A6, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6-201ENST00000262462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
SLC27A6-201ENST00000262462 SMARCA4P51532 1647 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC27A6-201ENST00000262462 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.7■■□□□ 1.23
SLC27A6-201ENST00000262462 ARAP1Q96P48 1450 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC27A6-201ENST00000262462 MAPKBP1O60336 1514 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC27A6-201ENST00000262462 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SLC27A6-201ENST00000262462 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6-201ENST00000262462 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6-201ENST00000262462 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6-201ENST00000262462 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6-201ENST00000262462 TONSLQ96HA7 1378 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC27A6-201ENST00000262462 P3H3Q8IVL6 736 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC27A6-201ENST00000262462 IL27Q8NEV9 243 aa22.58■■□□□ 1.21
SLC27A6-201ENST00000262462 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC184Q52MB2 194 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC27A6-201ENST00000262462 CUX2O14529 1486 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC27A6-201ENST00000262462 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
SLC27A6-201ENST00000262462 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
SLC27A6-201ENST00000262462 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SLC27A6-201ENST00000262462 MRS2Q9HD23 443 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC27A6-201ENST00000262462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC27A6-201ENST00000262462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC27A6-201ENST00000262462 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SLC27A6-201ENST00000262462 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC27A6-201ENST00000262462 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC27A6-201ENST00000262462 PRXQ9BXM0 1461 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC27A6-201ENST00000262462 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC27A6-201ENST00000262462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SLC27A6-201ENST00000262462 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC27A6-201ENST00000262462 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC27A6-201ENST00000262462 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SLC27A6-201ENST00000262462 NEFMP07197 916 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC27A6-201ENST00000262462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC27A6-201ENST00000262462 KIF27Q86VH2 1401 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 AKNAQ7Z591 1439 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 TOP2BQ02880 1626 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC27A6-201ENST00000262462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC27A6-201ENST00000262462 TIAM1Q13009 1591 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC27A6-201ENST00000262462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC27A6-201ENST00000262462 FOXD1Q16676 465 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC27A6-201ENST00000262462 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC27A6-201ENST00000262462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC27A6-201ENST00000262462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC27A6-201ENST00000262462 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6-201ENST00000262462 NUDCQ9Y266 331 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC27A6-201ENST00000262462 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6-201ENST00000262462 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC27A6-201ENST00000262462 SLC4A3P48751 1232 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6-201ENST00000262462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SLC27A6-201ENST00000262462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 PDE4AP27815 886 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 SKAP1Q86WV1 359 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 CCDC7Q96M83 1385 aa22■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 UACAQ9BZF9 1416 aa22■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 CUX1P39880 1505 aa22■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 EXOC6Q8TAG9 804 aa22■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 IGF1RP08069 1367 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 PTPRKQ15262 1439 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC27A6-201ENST00000262462 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 TMC1Q8TDI8 760 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.94■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 USP35Q9P2H5 1018 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 GSE1Q14687 1217 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC27A6-201ENST00000262462 MAP3K1Q13233 1512 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 ARID3CA6NKF2 412 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 NAIPQ13075 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 HFM1A2PYH4 1435 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 BACH2Q9BYV9 841 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 FMN1Q68DA7 1419 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 NFKBIBQ15653 356 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 PLIN1O60240 522 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 NCOA2Q15596 1464 aa21.83■■□□□ 1.09
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