RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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UTP18-201ENST00000225298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
UTP18-201ENST00000225298 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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UTP18-201ENST00000225298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
UTP18-201ENST00000225298 P3H3Q8IVL6 736 aa28.94■■■□□ 2.22
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UTP18-201ENST00000225298 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.89■■■□□ 2.22
UTP18-201ENST00000225298 FMN1Q68DA7 1419 aa28.89■■■□□ 2.22
UTP18-201ENST00000225298 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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UTP18-201ENST00000225298 SYNJ2O15056 1496 aa28.86■■■□□ 2.21
UTP18-201ENST00000225298 GRIN2AQ12879 1464 aa28.86■■■□□ 2.21
UTP18-201ENST00000225298 MAP3K1Q13233 1512 aa28.85■■■□□ 2.21
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UTP18-201ENST00000225298 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.78■■■□□ 2.2
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UTP18-201ENST00000225298 CEP170Q5SW79 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
UTP18-201ENST00000225298 KIAA0556O60303 1618 aa28.55■■■□□ 2.16
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UTP18-201ENST00000225298 DISP1Q96F81 1524 aa28.52■■■□□ 2.16
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UTP18-201ENST00000225298 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.51■■■□□ 2.16
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UTP18-201ENST00000225298 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.47■■■□□ 2.15
UTP18-201ENST00000225298 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.47■■■□□ 2.15
UTP18-201ENST00000225298 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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UTP18-201ENST00000225298 CHD1O14646 1710 aa28.4■■■□□ 2.14
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UTP18-201ENST00000225298 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.36■■■□□ 2.13
UTP18-201ENST00000225298 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.36■■■□□ 2.13
UTP18-201ENST00000225298 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.36■■■□□ 2.13
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UTP18-201ENST00000225298 SHROOM2Q13796 1616 aa28.17■■■□□ 2.1
UTP18-201ENST00000225298 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.16■■■□□ 2.1
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UTP18-201ENST00000225298 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.99■■■□□ 2.07
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UTP18-201ENST00000225298 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 DAPK1P53355 1430 aa27.69■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.69■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.68■■■□□ 2.02
UTP18-201ENST00000225298 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
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UTP18-201ENST00000225298 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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