RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000204679.8

GNPTG-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTG, Length 1,983 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-201ENST00000204679 GRIN2BQ13224 1484 aa35.8■■■■□ 3.32
GNPTG-201ENST00000204679 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.74■■■■□ 3.31
GNPTG-201ENST00000204679 HRCP23327 699 aa35.74■■■■□ 3.31
GNPTG-201ENST00000204679 ADAMTS12P58397 1594 aa35.73■■■■□ 3.31
GNPTG-201ENST00000204679 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
GNPTG-201ENST00000204679 P3H3Q8IVL6 736 aa35.64■■■■□ 3.3
GNPTG-201ENST00000204679 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.63■■■■□ 3.29
GNPTG-201ENST00000204679 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.57■■■■□ 3.29
GNPTG-201ENST00000204679 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.56■■■■□ 3.28
GNPTG-201ENST00000204679 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
GNPTG-201ENST00000204679 SAMD9Q5K651 1589 aa35.47■■■■□ 3.27
GNPTG-201ENST00000204679 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
GNPTG-201ENST00000204679 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
GNPTG-201ENST00000204679 IQGAP2Q13576 1575 aa35.42■■■■□ 3.26
GNPTG-201ENST00000204679 GRIN2AQ12879 1464 aa35.39■■■■□ 3.26
GNPTG-201ENST00000204679 TIAM1Q13009 1591 aa35.37■■■■□ 3.25
GNPTG-201ENST00000204679 MAP3K1Q13233 1512 aa35.35■■■■□ 3.25
GNPTG-201ENST00000204679 FMN1Q68DA7 1419 aa35.34■■■■□ 3.25
GNPTG-201ENST00000204679 SYNJ2O15056 1496 aa35.33■■■■□ 3.25
GNPTG-201ENST00000204679 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
GNPTG-201ENST00000204679 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.32■■■■□ 3.24
GNPTG-201ENST00000204679 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.32■■■■□ 3.24
GNPTG-201ENST00000204679 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
GNPTG-201ENST00000204679 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.27■■■■□ 3.24
GNPTG-201ENST00000204679 FBLN2P98095 1184 aa35.25■■■■□ 3.23
GNPTG-201ENST00000204679 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.25■■■■□ 3.23
GNPTG-201ENST00000204679 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.21■■■■□ 3.23
GNPTG-201ENST00000204679 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.2■■■■□ 3.23
GNPTG-201ENST00000204679 CEP170Q5SW79 1584 aa35.18■■■■□ 3.22
GNPTG-201ENST00000204679 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
GNPTG-201ENST00000204679 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
GNPTG-201ENST00000204679 NUP160Q12769 1436 aa35.07■■■■□ 3.21
GNPTG-201ENST00000204679 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
GNPTG-201ENST00000204679 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
GNPTG-201ENST00000204679 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.06■■■■□ 3.2
GNPTG-201ENST00000204679 DISP1Q96F81 1524 aa35.06■■■■□ 3.2
GNPTG-201ENST00000204679 KIAA0556O60303 1618 aa35.05■■■■□ 3.2
GNPTG-201ENST00000204679 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
GNPTG-201ENST00000204679 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.98■■■■□ 3.19
GNPTG-201ENST00000204679 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.95■■■■□ 3.19
GNPTG-201ENST00000204679 HECW1Q76N89 1606 aa34.94■■■■□ 3.18
GNPTG-201ENST00000204679 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.9■■■■□ 3.18
GNPTG-201ENST00000204679 JPH4Q96JJ6 628 aa34.9■■■■□ 3.18
GNPTG-201ENST00000204679 CHD1O14646 1710 aa34.89■■■■□ 3.18
GNPTG-201ENST00000204679 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.89■■■■□ 3.18
GNPTG-201ENST00000204679 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
GNPTG-201ENST00000204679 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.82■■■■□ 3.16
GNPTG-201ENST00000204679 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.78■■■■□ 3.16
GNPTG-201ENST00000204679 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
GNPTG-201ENST00000204679 ARID3CA6NKF2 412 aa34.76■■■■□ 3.16
GNPTG-201ENST00000204679 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.76■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.76■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 ITGAEP38570 1179 aa34.75■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 NCOA2Q15596 1464 aa34.71■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
GNPTG-201ENST00000204679 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.65■■■■□ 3.14
GNPTG-201ENST00000204679 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
GNPTG-201ENST00000204679 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.64■■■■□ 3.14
GNPTG-201ENST00000204679 ARHGEF11O15085 1522 aa34.59■■■■□ 3.13
GNPTG-201ENST00000204679 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.59■■■■□ 3.13
GNPTG-201ENST00000204679 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.56■■■■□ 3.128e-7■■■□□ 16.1
GNPTG-201ENST00000204679 SHROOM2Q13796 1616 aa34.54■■■■□ 3.12
GNPTG-201ENST00000204679 ABCA8O94911 1581 aa34.5■■■■□ 3.11
GNPTG-201ENST00000204679 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
GNPTG-201ENST00000204679 PTPRGP23470 1445 aa34.46■■■■□ 3.11
GNPTG-201ENST00000204679 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.43■■■■□ 3.1
GNPTG-201ENST00000204679 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.42■■■■□ 3.1
GNPTG-201ENST00000204679 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
GNPTG-201ENST00000204679 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.4■■■■□ 3.1
GNPTG-201ENST00000204679 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.39■■■■□ 3.1
GNPTG-201ENST00000204679 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.38■■■■□ 3.09
GNPTG-201ENST00000204679 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
GNPTG-201ENST00000204679 ATP10BO94823 1461 aa34.33■■■■□ 3.09
GNPTG-201ENST00000204679 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
GNPTG-201ENST00000204679 MIA2Q96PC5 1412 aa34.32■■■■□ 3.08
GNPTG-201ENST00000204679 PTPRKQ15262 1439 aa34.3■■■■□ 3.08
GNPTG-201ENST00000204679 UACAQ9BZF9 1416 aa34.25■■■■□ 3.07
GNPTG-201ENST00000204679 KIF14Q15058 1648 aa34.25■■■■□ 3.07
GNPTG-201ENST00000204679 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.25■■■■□ 3.07
GNPTG-201ENST00000204679 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.23■■■■□ 3.07
GNPTG-201ENST00000204679 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.23■■■■□ 3.07
GNPTG-201ENST00000204679 HFM1A2PYH4 1435 aa34.15■■■■□ 3.06
GNPTG-201ENST00000204679 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.14■■■■□ 3.06
GNPTG-201ENST00000204679 ABCC2Q92887 1545 aa34.13■■■■□ 3.05
GNPTG-201ENST00000204679 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
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GNPTG-201ENST00000204679 NAIPQ13075 1403 aa34.08■■■■□ 3.05
GNPTG-201ENST00000204679 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 MAPKBP1O60336 1514 aa34.04■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.02■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.02■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 DAPK1P53355 1430 aa34.02■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.02■■■■□ 3.04
GNPTG-201ENST00000204679 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
GNPTG-201ENST00000204679 OSCARQ8IYS5 282 aa33.98■■■■□ 3.03
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