RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000125541.1

Trnp1-202, Transcript of TMF-regulated nuclear protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trnp1, Length 1,654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP48.44■■■■■ 5.34
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Trnp1-202ENSMUST00000125541 Setd1bQ8CFT2 1985 aa48.36■■■■■ 5.33
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Erich3F6QRE9 1637 aa48.33■■■■■ 5.33
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ankrd26Q811D2 1581 aa48.32■■■■■ 5.33
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Setd5Q5XJV7 1441 aa48.31■■■■■ 5.32
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa48.27■■■■■ 5.32
Trnp1-202ENSMUST00000125541 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Cux1P53564 1515 aa48.25■■■■■ 5.31
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Rusc2Q80U22 1514 aa48.24■■■■■ 5.31
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Fyco1Q8VDC1 1437 aa48.22■■■■■ 5.31
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Arap1Q4LDD4 1452 aa48.15■■■■■ 5.3
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Adamts12Q811B3 1600 aa48.11■■■■■ 5.29
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Shroom2A2ALU4 1481 aa48.07■■■■■ 5.29
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa48.07■■■■■ 5.29
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
Trnp1-202ENSMUST00000125541 CadpsQ80TJ1 1355 aa47.98■■■■■ 5.27
Trnp1-202ENSMUST00000125541 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa47.96■■■■■ 5.27
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Trnp1-202ENSMUST00000125541 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa47.91■■■■■ 5.26
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Pcf11G3X9Z4 1553 aa47.89■■■■■ 5.26
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Abca16E9PWJ7 1678 aa47.84■■■■■ 5.25
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Dnajc5P60904 198 aa47.84■■■■■ 5.25
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Soga1E1U8D0 1418 aa47.82■■■■■ 5.25
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Tiam1Q60610 1591 aa47.8■■■■■ 5.24
Trnp1-202ENSMUST00000125541 CntlnA2AM05 1397 aa47.78■■■■■ 5.24
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Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa47.71■■■■■ 5.23
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Aebp1Q640N1 1128 aa47.7■■■■■ 5.23
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Naip1Q9QWK5 1403 aa47.67■■■■■ 5.22
Trnp1-202ENSMUST00000125541 BlmO88700 1416 aa47.65■■■■■ 5.22
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Peg3Q3URU2 1571 aa47.65■■■■■ 5.22
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa47.63■■■■■ 5.21
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Abcc2Q8VI47 1543 aa47.61■■■■■ 5.21
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa47.54■■■■■ 5.2
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Slx4Q6P1D7 1565 aa47.51■■■■■ 5.2
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Arhgap27A2AB59 869 aa47.46■■■■■ 5.19
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Map3k4O08648 1597 aa47.44■■■■■ 5.18
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Fgd6Q69ZL1 1399 aa47.41■■■■■ 5.18
Trnp1-202ENSMUST00000125541 UbtfP25976 765 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Col17a1Q07563 1470 aa47.36■■■■■ 5.17
Trnp1-202ENSMUST00000125541 WrnO09053 1401 aa47.35■■■■■ 5.17
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Kif27Q7M6Z4 1394 aa47.31■■■■■ 5.16
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa47.27■■■■■ 5.16
Trnp1-202ENSMUST00000125541 BC005561E9Q5E2 1589 aa47.15■■■■■ 5.14
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa47.1■■■■■ 5.13
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Neo1P97798 1493 aa47.07■■■■■ 5.12
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Lmod2Q3UHZ5 550 aa47.06■■■■■ 5.12
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Mier1Q5UAK0 511 aa47.04■■■■■ 5.12
Trnp1-202ENSMUST00000125541 AknaQ80VW7 1404 aa47.04■■■■■ 5.12
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa46.97■■■■■ 5.11
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Trnp1-202ENSMUST00000125541 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Jph4Q80WT0 628 aa46.93■■■■■ 5.1
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa46.92■■■■■ 5.1
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ncoa2Q61026 1462 aa46.92■■■■■ 5.1
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa46.92■■■■■ 5.1
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Abcc1O35379 1528 aa46.9■■■■■ 5.1
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa46.86■■■■■ 5.09
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Gm14025A2AP89 1413 aa46.84■■■■■ 5.09
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa46.84■■■■■ 5.09
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Arhgef11Q68FM7 1552 aa46.83■■■■■ 5.09
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Mug1P28665 1476 aa46.82■■■■■ 5.09
Trnp1-202ENSMUST00000125541 NexmifQ5DTT1 1515 aa46.76■■■■■ 5.08
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ncoa3O09000 1398 aa46.75■■■■■ 5.07
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Chd1P40201 1711 aa46.74■■■■■ 5.07
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Gcc2Q8CHG3 1679 aa46.74■■■■■ 5.07
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Cep170Q6A065 1588 aa46.73■■■■■ 5.07
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ccnb3Q810T2 1396 aa46.69■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Magi1Q6RHR9 1471 aa46.68■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Adgrl3Q80TS3 1537 aa46.66■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa46.66■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Fam163aQ8CAA5 168 aa46.65■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP46.65■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa46.64■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Mroh2aD3Z750 1679 aa46.64■■■■■ 5.06
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Gm156Q58A37 223 aa46.62■■■■■ 5.05
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa46.62■■■■■ 5.05
Trnp1-202ENSMUST00000125541 PtprtQ99M80 1454 aa46.54■■■■■ 5.04
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa46.53■■■■■ 5.04
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Kdm5bQ80Y84 1544 aa46.52■■■■■ 5.04
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Trnp1-202ENSMUST00000125541 Fancd2Q80V62 1450 aa46.47■■■■■ 5.03
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Prex2Q3LAC4 1598 aa46.37■■■■■ 5.01
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa46.36■■■■■ 5.01
Trnp1-202ENSMUST00000125541 A2mQ6GQT1 1474 aa46.32■■■■■ 5.01
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Mia2Q91ZV0 1396 aa46.31■■■■■ 5
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Wdr7Q920I9 1489 aa46.31■■■■■ 5
Trnp1-202ENSMUST00000125541 NhsB1AV60 1647 aa46.3■■■■■ 5
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Cul7Q8VE73 1689 aa46.3■■■■■ 5
Trnp1-202ENSMUST00000125541 Naip2Q9QUK4 1447 aa46.28■■■■■ 5
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