RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rusc2Q80U22 1514 aa45.38■■■■■ 4.86
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpap1Q80TE0 1409 aa45.31■■■■■ 4.84
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Setd1bQ8CFT2 1985 aa45.29■■■■■ 4.84
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eea1Q8BL66 1411 aa45.21■■■■■ 4.83
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fyco1Q8VDC1 1437 aa45.12■■■■■ 4.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adamts12Q811B3 1600 aa45.11■■■■■ 4.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cux1P53564 1515 aa45.1■■■■■ 4.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankrd26Q811D2 1581 aa45.09■■■■■ 4.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Setd5Q5XJV7 1441 aa45.08■■■■■ 4.81
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Erich3F6QRE9 1637 aa45.02■■■■■ 4.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa45.01■■■■■ 4.8
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CadpsQ80TJ1 1355 aa44.99■■■■■ 4.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 WizO88286 1684 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa44.92■■■■■ 4.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arap1Q4LDD4 1452 aa44.85■■■■■ 4.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abca16E9PWJ7 1678 aa44.85■■■■■ 4.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Soga1E1U8D0 1418 aa44.85■■■■■ 4.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abca5Q8K448 1642 aa44.84■■■■■ 4.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PxdnQ3UQ28 1475 aa44.82■■■■■ 4.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa44.76■■■■■ 4.76
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abcc2Q8VI47 1543 aa44.7■■■■■ 4.75
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fgd6Q69ZL1 1399 aa44.69■■■■■ 4.75
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcf11G3X9Z4 1553 aa44.67■■■■■ 4.74
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgap27A2AB59 869 aa44.62■■■■■ 4.73
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aebp1Q640N1 1128 aa44.61■■■■■ 4.73
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CntlnA2AM05 1397 aa44.6■■■■■ 4.73
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map3k4O08648 1597 aa44.58■■■■■ 4.73
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 BlmO88700 1416 aa44.56■■■■■ 4.72
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa44.53■■■■■ 4.72
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Shroom2A2ALU4 1481 aa44.5■■■■■ 4.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tiam1Q60610 1591 aa44.5■■■■■ 4.71
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 WrnO09053 1401 aa44.43■■■■■ 4.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Naip1Q9QWK5 1403 aa44.43■■■■■ 4.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Peg3Q3URU2 1571 aa44.42■■■■■ 4.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slx4Q6P1D7 1565 aa44.41■■■■■ 4.7
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa44.32■■■■■ 4.68
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AknaQ80VW7 1404 aa44.31■■■■■ 4.68
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif27Q7M6Z4 1394 aa44.3■■■■■ 4.68
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 BC005561E9Q5E2 1589 aa44.28■■■■■ 4.68
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Neo1P97798 1493 aa44.27■■■■■ 4.68
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abcc1O35379 1528 aa44.14■■■■■ 4.66
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Jph4Q80WT0 628 aa44.14■■■■■ 4.66
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa44.13■■■■■ 4.65
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm14025A2AP89 1413 aa44.1■■■■■ 4.65
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa44.08■■■■■ 4.65
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa44.02■■■■■ 4.64
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ncoa2Q61026 1462 aa44■■■■■ 4.63
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 UbtfP25976 765 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa43.95■■■■■ 4.63
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmod2Q3UHZ5 550 aa43.94■■■■■ 4.62
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chd1P40201 1711 aa43.92■■■■■ 4.62
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef11Q68FM7 1552 aa43.82■■■■■ 4.61
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mug1P28665 1476 aa43.81■■■■■ 4.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa43.79■■■■■ 4.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ncoa3O09000 1398 aa43.76■■■■■ 4.6
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Magi1Q6RHR9 1471 aa43.75■■■■■ 4.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm5bQ80Y84 1544 aa43.74■■■■■ 4.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam163aQ8CAA5 168 aa43.73■■■■■ 4.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa43.73■■■■■ 4.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NexmifQ5DTT1 1515 aa43.68■■■■■ 4.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mroh2aD3Z750 1679 aa43.68■■■■■ 4.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa43.66■■■■■ 4.58
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccnb3Q810T2 1396 aa43.61■■■■■ 4.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fancd2Q80V62 1450 aa43.6■■■■■ 4.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa43.57■■■■■ 4.57
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gcc2Q8CHG3 1679 aa43.55■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igf1rQ60751 1373 aa43.55■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa43.54■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa43.54■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep170Q6A065 1588 aa43.53■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PtprtQ99M80 1454 aa43.51■■■■■ 4.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa43.5■■■■■ 4.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr7Q920I9 1489 aa43.48■■■■■ 4.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NhsB1AV60 1647 aa43.46■■■■■ 4.55
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prex2Q3LAC4 1598 aa43.43■■■■■ 4.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mier1Q5UAK0 511 aa43.42■■■■■ 4.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa43.42■■■■■ 4.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AI481877A2ALV5 1481 aa43.41■■■■■ 4.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cul7Q8VE73 1689 aa43.39■■■■■ 4.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa43.28■■■■■ 4.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa43.28■■■■■ 4.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm156Q58A37 223 aa43.26■■■■■ 4.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col17a1Q07563 1470 aa43.25■■■■■ 4.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp10dQ8K2X1 1416 aa43.23■■■■■ 4.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adgrl3Q80TS3 1537 aa43.21■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.1 ms