RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpap1Q80TE0 1409 aa17.91■□□□□ 0.46
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aebp1Q640N1 1128 aa17.9■□□□□ 0.46
Herc3-201ENSMUST00000031823 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2r1Q62028 1487 aa17.89■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magi3Q9EQJ9 1476 aa17.89■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa17.89■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fyco1Q8VDC1 1437 aa17.88■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 BlmO88700 1416 aa17.87■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cux1P53564 1515 aa17.85■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 CadpsQ80TJ1 1355 aa17.84■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arap1Q4LDD4 1452 aa17.83■□□□□ 0.45
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa17.79■□□□□ 0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa17.78■□□□□ 0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mier1Q5UAK0 511 aa17.78■□□□□ 0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd26Q811D2 1581 aa17.76■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 AknaQ80VW7 1404 aa17.76■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 CntlnA2AM05 1397 aa17.76■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 WrnO09053 1401 aa17.74■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif27Q7M6Z4 1394 aa17.74■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa17.72■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 PxdnQ3UQ28 1475 aa17.71■□□□□ 0.43
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rusc2Q80U22 1514 aa17.7■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa17.7■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naip1Q9QWK5 1403 aa17.69■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 WizO88286 1684 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgd6Q69ZL1 1399 aa17.68■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Soga1E1U8D0 1418 aa17.66■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcf11G3X9Z4 1553 aa17.65■□□□□ 0.42
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa17.62■□□□□ 0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamts12Q811B3 1600 aa17.62■□□□□ 0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpatch8A2A6A1 1505 aa17.61■□□□□ 0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jph4Q80WT0 628 aa17.6■□□□□ 0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tiam1Q60610 1591 aa17.6■□□□□ 0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erich3F6QRE9 1637 aa17.58■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neo1P97798 1493 aa17.56■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Setd1bQ8CFT2 1985 aa17.56■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2uB1AUC4 352 aa17.54■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shroom2A2ALU4 1481 aa17.54■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa17.52■□□□□ 0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abca5Q8K448 1642 aa17.52■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slx4Q6P1D7 1565 aa17.52■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 NefmP08553 848 aa17.51■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abca16E9PWJ7 1678 aa17.51■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcc2Q8VI47 1543 aa17.49■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm14025A2AP89 1413 aa17.47■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccnb3Q810T2 1396 aa17.47■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa17.46■□□□□ 0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chic2Q9D9G3 165 aa17.45■□□□□ 0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncoa2Q61026 1462 aa17.4■□□□□ 0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa17.38■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mug1P28665 1476 aa17.38■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map3k4O08648 1597 aa17.38■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncoa3O09000 1398 aa17.38■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcc1O35379 1528 aa17.37■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam163aQ8CAA5 168 aa17.35■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC005561E9Q5E2 1589 aa17.34■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Peg3Q3URU2 1571 aa17.33■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa17.33■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa17.33■□□□□ 0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 NexmifQ5DTT1 1515 aa17.33■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arid3cA6PWV5 409 aa17.33■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 NclP09405 707 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magi1Q6RHR9 1471 aa17.33■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eid3Q3V124 375 aa17.32■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa17.29■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cabp1Q9JLK7 227 aa17.28■□□□□ 0.36
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtus2Q3UHD3 1353 aa17.26■□□□□ 0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tdrd9Q14BI7 1383 aa17.25■□□□□ 0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mia2Q91ZV0 1396 aa17.24■□□□□ 0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa17.23■□□□□ 0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa17.22■□□□□ 0.35
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igf1rQ60751 1373 aa17.2■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fancd2Q80V62 1450 aa17.2■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef11Q68FM7 1552 aa17.2■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa17.19■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa17.19■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm156Q58A37 223 aa17.19■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prex2Q3LAC4 1598 aa17.18■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccer2J3QPU5 274 aa17.18■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekhh2Q8C115 1491 aa17.18■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 A2mQ6GQT1 1474 aa17.18■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
Herc3-201ENSMUST00000031823 TonslQ6NZL6 1363 aa17.17■□□□□ 0.34
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