RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.24□□□□□ -1.09not detected
15S_rRNA15S_rRNA ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
15S_rRNA15S_rRNA RTG3P38165 486 aa8.21□□□□□ -1.1
15S_rRNA15S_rRNA PTC4P38089 393 aa8.18□□□□□ -1.1
15S_rRNA15S_rRNA MGA2P40578 1113 aa8.18□□□□□ -1.1
15S_rRNA15S_rRNA STS1P38637 319 aa8.16□□□□□ -1.1
15S_rRNA15S_rRNA HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA HTA2P04912 132 aa8.14□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA YEL023CP39992 682 aa8.14□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA GYP5Q12344 894 aa8.12□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA DCW1P36091 449 aa8.11□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA RCR1P38212 213 aa8.11□□□□□ -1.11
15S_rRNA15S_rRNA PML39Q03760 334 aa8.06□□□□□ -1.12
15S_rRNA15S_rRNA ARH1P48360 493 aa8□□□□□ -1.13
15S_rRNA15S_rRNA YPL062WQ02781 134 aa7.94□□□□□ -1.14
15S_rRNA15S_rRNA SPT23P35210 1082 aa7.92□□□□□ -1.14
15S_rRNA15S_rRNA RAS1P01119 309 aa7.9□□□□□ -1.14
15S_rRNA15S_rRNA MID1P41821 548 aa7.83□□□□□ -1.16
15S_rRNA15S_rRNA TRK1P12685 1235 aa7.81□□□□□ -1.16
15S_rRNA15S_rRNA GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
15S_rRNA15S_rRNA MIF2P35201 549 aa7.79□□□□□ -1.16
15S_rRNA15S_rRNA PEX29Q03370 554 aa7.75□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA RAM2P29703 316 aa7.74□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA EDS1P38073 919 aa7.74□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA ATH1P48016 1211 aa7.73□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA HAP5Q02516 242 aa7.73□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
15S_rRNA15S_rRNA GUT1P32190 709 aa7.7□□□□□ -1.18
15S_rRNA15S_rRNA BNI4P53858 892 aa7.7□□□□□ -1.18
15S_rRNA15S_rRNA NST1P53935 1240 aa7.65□□□□□ -1.18
15S_rRNA15S_rRNA COQ8P27697 501 aa7.64□□□□□ -1.19
15S_rRNA15S_rRNA SOL3P38858 249 aa7.63□□□□□ -1.19
15S_rRNA15S_rRNA AMS1P22855 1083 aa7.6□□□□□ -1.19
15S_rRNA15S_rRNA MPH3P0CE00 602 aa7.57□□□□□ -1.2
15S_rRNA15S_rRNA AI4P03878 556 aa7.55□□□□□ -1.2
15S_rRNA15S_rRNA GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data7.54□□□□□ -1.2not detected
15S_rRNA15S_rRNA GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
15S_rRNA15S_rRNA ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
15S_rRNA15S_rRNA YGR273CP53329 174 aa7.49□□□□□ -1.21
15S_rRNA15S_rRNA NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
15S_rRNA15S_rRNA YPR015CQ12531 247 aa7.46□□□□□ -1.21
15S_rRNA15S_rRNA MPC54Q08550 464 aa7.45□□□□□ -1.22
15S_rRNA15S_rRNA GYP1Q08484 637 aa7.43□□□□□ -1.22
15S_rRNA15S_rRNA NMA111P53920 997 aa7.42□□□□□ -1.22
15S_rRNA15S_rRNA SLI15P38283 698 aa7.41□□□□□ -1.22
15S_rRNA15S_rRNA BRE2P43132 505 aa7.36□□□□□ -1.23
15S_rRNA15S_rRNA DPL1Q05567 589 aa7.36□□□□□ -1.23
15S_rRNA15S_rRNA SDH2P21801 266 aa7.35□□□□□ -1.23
15S_rRNA15S_rRNA RAM1P22007 431 aa7.33□□□□□ -1.24
15S_rRNA15S_rRNA KEX1P09620 729 aa7.31□□□□□ -1.24
15S_rRNA15S_rRNA GCR2Q01722 534 aa7.3□□□□□ -1.24
15S_rRNA15S_rRNA YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.29□□□□□ -1.24
15S_rRNA15S_rRNA ISU2Q12056 156 aa7.28□□□□□ -1.24
15S_rRNA15S_rRNA SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
15S_rRNA15S_rRNA CDC73Q06697 393 aa7.27□□□□□ -1.25
15S_rRNA15S_rRNA UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
15S_rRNA15S_rRNA YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
15S_rRNA15S_rRNA VHR2P40041 505 aa7.23□□□□□ -1.25
15S_rRNA15S_rRNA SAS4Q04003 481 aa7.23□□□□□ -1.25
15S_rRNA15S_rRNA PDR1P12383 1068 aa7.2□□□□□ -1.26
15S_rRNA15S_rRNA PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.19□□□□□ -1.26not detected
15S_rRNA15S_rRNA AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
15S_rRNA15S_rRNA RAD54P32863 898 aa7.15□□□□□ -1.27
15S_rRNA15S_rRNA MET22P32179 357 aa7.14□□□□□ -1.27
15S_rRNA15S_rRNA MTC5Q03897 1148 aa7.11□□□□□ -1.27
15S_rRNA15S_rRNA MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
15S_rRNA15S_rRNA RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
15S_rRNA15S_rRNA CLA4P48562 842 aa7.08□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA YDR090CQ03193 310 aa7.08□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA ENV9Q08651 330 aa7.08□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA YRR1Q12172 810 aa7.05□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA KIC1P38692 1080 aa7.05□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA PEX21P50091 288 aa7.03□□□□□ -1.28
15S_rRNA15S_rRNA PRT1P06103 763 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA YPR148CQ06523 435 aa7□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA IFH1P39520 1085 aa6.99□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA YDR444WQ04093 687 aa6.99□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA STR2P47164 639 aa6.98□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA ISM1P48526 1002 aa6.98□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA YDL176WQ12027 708 aa6.98□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA CSC1Q06538 782 aa6.97□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
15S_rRNA15S_rRNA ERG12P07277 443 aa6.96□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA NUD1P32336 851 aa6.95□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA CST6P40535 587 aa6.95□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA TFB4Q12004 338 aa6.95□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA VPS70P47161 811 aa6.93□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA NPL4P33755 580 aa6.91□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
15S_rRNA15S_rRNA CDC4P07834 779 aa6.9□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA ORC6P38826 435 aa6.9□□□□□ -1.31
15S_rRNA15S_rRNA SEC2P17065 759 aa6.88□□□□□ -1.31
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