RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635675.2

LINC00339-210, long intergenic non-protein coding RNA 339, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00339, Length 1,404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00339-210ENST00000635675 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.59□□□□□ -1.36
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LINC00339-210ENST00000635675 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.58□□□□□ -1.36
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LINC00339-210ENST00000635675 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.56□□□□□ -1.36
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LINC00339-210ENST00000635675 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 A0A1B0GUV1 79 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 S100A2P29034 98 aa6.5□□□□□ -1.37
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LINC00339-210ENST00000635675 PMCHL1Q16048 86 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 PKD1P98161 4303 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 A0A087WTM6 91 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 C5orf52A6NGY3 159 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 VCYO14598 125 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 TSHBP01222 138 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 PPBPP02775 128 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 AKR1D1P51857 326 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 ENHOQ6UWT2 76 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00339-210ENST00000635675 UBE2WQ96B02 151 aa6.49□□□□□ -1.37
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