RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.43□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.43□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.43□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 SSNA1O43805 119 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 LTAP01374 205 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 P01737 135 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 MBP02144 154 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 SERF2P84101 59 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 IFITM3Q01628 133 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 REG3GQ6UW15 175 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 STPG4Q8N801 248 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.42□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 A0A096LNI7 61 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 SNAI2O43623 268 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 SSTP61278 116 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 UBE2G1P62253 170 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 FMC1Q96HJ9 113 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.4□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GUV1 79 aa5.4□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 GZMBP10144 247 aa5.4□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 AQP10Q96PS8 301 aa5.4□□□□□ -1.54
TTR-204ENST00000610404 M0QY20 66 aa5.39□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 UPK1BO75841 260 aa5.39□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 CXCL1P09341 107 aa5.39□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.39□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 TMEM243Q9BU79 118 aa5.39□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 MUC2Q02817 5179 aa5.38□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.38□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 OR5AL1P0C617 328 aa5.38□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 SULT1A2P50226 295 aa5.38□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 MGPP08493 103 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 SMIM17P0DL12 118 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 AKR1C3P42330 323 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 Q5BKY6 102 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 CFAP161Q6P656 301 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 Q6ZRP5 223 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 AP1S3Q96PC3 154 aa5.37□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 H7C1H1 209 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 FHITP49789 147 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 CST9LP1Q5W188 147 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 S100ZQ8WXG8 99 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.36□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.35□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 STOML3Q8TAV4 291 aa5.35□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.35□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.35□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.35□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 UBE2L6O14933 153 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 PAGE4O60829 102 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 AMTP48728 403 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 RASL11AQ6T310 242 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 BAGE2Q86Y30 109 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 ALG5Q9Y673 324 aa5.34□□□□□ -1.55
TTR-204ENST00000610404 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 FAM231BA6NCW3 169 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 IGLC6P0CF74 106 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 MALP21145 153 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 COTL1Q14019 142 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 CARD19Q96LW7 228 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 TPPP3Q9BW30 176 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 NIT2Q9NQR4 276 aa5.33□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.32□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PNN7 141 aa5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 XCL1P47992 114 aa5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.31□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GV50 99 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 NTF3P20783 257 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 DEFA1P59665 94 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 CACNG7P62955 275 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 SYCNQ0VAF6 134 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 GAGE2BQ13066 116 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 TWIST1Q15672 202 aa5.3□□□□□ -1.56
TTR-204ENST00000610404 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.3□□□□□ -1.56
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